蛋白分析FAQ汇总

• • 富集或免疫沉淀是否可与TMT-MS3研究兼容？

  当然可以，基于TMT的工作流流程与各种蛋白质组技术兼容。相关服务:基于TMT的蛋白质组学分析

• • 什么是TMT-MS3？

  TMT-MS3是用于发现血浆生物标志物和分析其他高度复杂样本的标准工作流程，其最大的优势是定量的准确度高。该工作流程结合串联质标签（TMT）、先进的质谱（MS）、MS3碎片和生物信息学，在保持良好的覆盖度的同时提供最准确的定量结果。相关服务:基于TMT的蛋白质组学分析

• • 为什么要选择TMT-SRM而不是SRM析来验证候选生物标记物？

  TMT-SRM特别适合于在TMT工作流程（TMT-MS2、TMT-MS3）中验证候选者，与经典SRM相比，它提供了一种更快、更便宜的生物标记验证方法。相关服务:基于TMT的蛋白质组学分析

• • TMT-SRM相比基于抗体的方法来验证候选生物标记物的优势？

  TMT-SRM分析可以在一次分析中验证候选生物标志物，无需为Western Blotting或ELISA试剂盒购买多个抗体。且TMT-SRM特别适合验证没有商业抗体的蛋白质和翻译后修饰。相关服务:基于TMT的蛋白质组学分析

• • 串联质量标签（Tandem Mass Tag，TMT）试剂的主要用途是什么？

  TMT 技术被用于单独标记不同的蛋白质样品，以便将这些样品组合成单个样品进行 LC-MS 分析。该工作流程的主要优点是样品通量更高、仪器分析时间更少、重复之间肽定量的精度高，以及不同样品中缺失的定量蛋白质更少。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT，SILAC

• • 可以合并多少个样品同时进行多重蛋白质组质谱定量？

  SILAC 可用于同时分析2到3个样品。TMT 试剂可用于同时分析6至11个样品。TMTpro 试剂可用于同时分析多达16个样品。相关服务:定量蛋白组分析

• • 不同的质谱定量系统可以用于哪些样品类型？

  Label-free、TMT 试剂和 TMTpro 试剂可用于任何蛋白质样品类型。SILAC 和 Neucode 定量只能用于可进行代谢标记的细胞系和模型生物。相关服务:定量蛋白组分析

• • 可以将 TMT 试剂与 TMTpro 试剂结合使用吗？

  TMT 试剂和 TMTpro 试剂是具有不同质量的不同化学品。因此，不建议混合这两个标签，因为合并后的样本会更加复杂而导致定量的蛋白质更少。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT，SILAC

• • 与未标记的样品相比，TMT 标记的样品中的肽/蛋白质鉴定数量较少，这怎么办？

  建议对样品进行分馏，以降低 LC-MS 分析之前的样品复杂性，从而增加多重样品的可定量肽/蛋白质的数量。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT，SILAC

• • 样本 TMT 标记水平较低 (<95%)应该检查什么？

  通过使用 TMT/TMTpro 作为变量（即动态）修饰肽氨基末端和赖氨酸来搜索肽，可以确定单个标记样品的标记效率。对于大多数样品的完整标记，肽与标签的质量比（w:w）应为 1:4 至 1:8。TMT/TMTpro 试剂的不当储存或处理会导致标签上的 -NHS 基团水解，从而使试剂的反应性降低