为什么要将蛋白质消化成肽进行液相色谱-质谱分析，而不是直接分析蛋白质？

虽然质谱仪可以测量完整蛋白质的质量，但在蛋白质组学中分析肽而不是蛋白质的原因有很多：1、蛋白质可能难以处理，并且在相同的条件下可能并不都是可溶的。2、此外，质谱仪对蛋白质的灵敏度远低于对肽的灵敏度，并且蛋白质可能被处理和修饰，使得组合效应使得无法确定许多所得同种型的质量。此外，从序列中预测成熟，正确修饰的蛋白质的质量并不容易，或者相反，哪种蛋白质可能产生了测量的蛋白质质量。最重要的是，如果目的是鉴定蛋白质，则需要序列信息，并且质谱仪最有效地从长达约20个残基的肽中获取序列信息，而不是从整个蛋白质中获取序列信息。然而，使用非常专业的设备，从完整的蛋白质中获取部分序列信息成为可能，然后可以将其用于鉴定目的或以称为“自上而下”蛋白质测序的方法分析蛋白质修饰。

相关服务: