代谢组学FAQ汇总

• • 靶向检测粪便中短链脂肪酸的方法

  靶向检测粪便中短链脂肪酸（SCFAs）的方法通常涉及气相色谱（GC）技术，这是因为气相色谱特别适合于挥发性有机化合物的分析，而短链脂肪酸正是这类化合物。以下是具体步骤和注意事项：   1. 样品收集与准备 样品收集：粪便样本应在收集后尽快处理或冷冻保存，避免微生物活动改变短链脂肪酸的含量。样

• • 脂质代谢组学研究(Lipidomics)中，怎么提取脂质以及分离外泌体

  在脂质代谢组学研究中，提取脂质和分离外泌体是两个关键步骤，下面为您提供了这两个步骤的一些常用技术方法，希望对您有所帮助。一、提取脂质 常用方法有Folch和Bligh-Dyer两种 1.Folch方法：（1）将样本与氯仿和甲醇的混合溶剂（比例为2:1，v/v）充分混合。（2）添加适量的盐水，

• • 数据库查不到差异物质的功能

  建议采取以下几个步骤进一步探索：1.扩大代谢物数据库搜索范围：尝试使用更多的数据库进行查询，特别是那些专注于特定生物种类或具有特定代谢途径数据的数据库。例如，使用专门的植物代谢数据库（如PlantCyc）或微生物代谢数据库（如MicroCyc）可能会找到更多信息。2.跨数据库：代谢物的功能往

• • 筛选出来的差异代谢物质的作用应该去哪里查到比较可靠的结果

  筛选出的差异代谢物质的作用和信息可以通过以下几个途径来查找和验证，以确保结果的可靠性：   1.科学文献数据库： 如PubMed, ScienceDirect, Springer等。这些数据库收录了大量的科学研究论文，是获取最新科学发现和深入理解代谢物质作用的重要来源。   2. 化学物质和

• • 用simca怎么做plsda有方法吗

  在使用SIMCA软件进行偏最小二乘判别分析（）时，你可以按照以下步骤操作：   1.数据准备： 确保你的数据已经正确格式化和预处理。在SIMCA中进行PLS-DA分析前，通常需要准备好两个主要的数据矩阵：一个包含了预测变量（如光谱数据、化学测量等），另一个包含了响应变量（即分类变量，例如不同

• • 碱溶液提取多糖用的是什么碱溶液?多少浓度

  多糖的碱溶液提取通常使用氢氧化钠(NaOH)或氢氧化钾(KOH)作为碱溶液。这些碱性溶液能够破坏多糖与其他生物分子间的相互作用，如蛋白质和多糖之间的结合，从而使多糖释放到溶液中。   使用的碱溶液和浓度: 氢氧化钠(NaOH)溶液：浓度范围通常在1%到4%之间，具体浓度取决于原料的性质和所

• • 治疗组和正常组火山图中只有显著下调的代谢物,无显著上调的；但正常组与模型组、模型组与治疗组间都有上调和下调代谢物。这种情况合理吗

  这种情况是可能合理的，并不一定意味着数据分析存在问题。火山图是用来显示生物学实验中两组数据差异显著性和变化倍数的一种图形，通常用于基因表达数据或代谢组学数据的分析。在你的情况中，代谢组学分析显示治疗组和正常组间只有显著下调的代谢物，没有显著上调的代谢物，这可能意味着：   1.治疗效果 治疗

• • opls-da置换检验图怎样才不算过拟合

  在使用OPLS-DA（正交偏最小二乘判别分析）模型进行置换检验（Permutation Test）时，为了避免过拟合，关键指标是模型的预测能力（Q2值）与置换测试中生成的Q2值的分布。具体来说： 原始模型的Q2值应显著高于置换后的Q2值分布。这意味着，原始数据的模型拟合效果应显著好于随机排

• • 类胡萝卜素靶向代谢组的图怎么分析

  分析和解读类胡萝卜素靶向代谢组学研究中生成的图形数据，常涉及对代谢物的鉴定、定量以及它们在不同条件下的变化。下面是一些基本的分析方法和步骤： 1.识别图表类型： 代谢组图通常可能是热图、点图、或者条形图等，每种图表展示数据的方式不同。 2.理解轴标签和单位： X轴通常表示不同的样

• • 血清代谢组学的标本处理方法？

  血清代谢组学的标本处理方法通常包括以下步骤： 1.血液采集： 采集静脉血，让其自然凝固（避免使用抗凝剂），以便分离出血清。   2.凝血与离心： 血液在室温下静置30-60分钟，允许完全凝固，然后离心（约2000-3000 g，10分钟），以分离血清和凝块。   3.血清收集： 小心地收集上