代谢组学FAQ汇总

• • 代谢组学需要的试剂和名称有吗？

  在代谢组学研究中，常用的试剂和名称包括：1、 样品制备和萃取：甲醇（Methanol）：广泛用于样品的预处理和萃取。乙腈（Acetonitrile）：用于样品萃取和蛋白质沉淀。氯仿（Chloroform）：常用于脂质类代谢物的萃取。2、衍生化试剂：甲酰胺（Formamide）：用于氨基酸和其

• • 有没有木瓜蛋白酶除多糖蛋白的方法

  以下是木瓜蛋白酶除多糖蛋白（蛋白质与多糖复合体）的具体方法步骤，可供您进行参考：1.准备样品: 确保你的样品中的多糖蛋白浓度适合于酶处理。过高或过低的浓度都可能影响效果。   2.选择适当的缓冲液: 通常，pH值在6.0到7.0之间的缓冲液最适合木瓜蛋白酶的活性。常用的缓冲液包括磷酸盐缓冲液

• • 单独测了非靶向代谢,没有设置对照组,只想了解里面的物质组成该怎么分析？样本数据如何展示？

  如果您的研究中只关注非靶向代谢物的组成，而没有设置对照组，您可以采用以下步骤来分析数据和展示样本信息：一、数据分析步骤 1.数据预处理：峰检测与整合：使用适当的软件工具对质谱数据进行峰检测，整合，以确认代谢物的信号。 校正：进行基线校正、噪声过滤和信号强度归一化等，以优化数据质量。2.代谢物

• • PLS-DA/OPLS-DA二维图中q2为负值是什么意思

  在PLS-DA（偏最小二乘判别分析）或OPLS-DA（正交偏最小二乘判别分析）的二维图中，q²值（Q-squared）衡量的是模型对数据的交叉验证预测效果，理想的q²值应接近1。q²值为负表示模型的预测能力较差，通常意味着模型未能有效地捕捉数据中的相关变异，或者存在过拟合，表明模型对数据的解

• • 血清还是血浆做代谢组学好

  血浆和血清都是都是代谢组学分析中常用的样本，它们各自具有独特的优势和应用场景，具体选用哪种还需要根据您的研究需求和目的，下面是一些它们各自的适用场景可供您参考：血浆适用场景（1）动态过程的研究：血浆是在血液中加入抗凝剂后离心得到的上清液，包含了血液中几乎全部的代谢物，包括那些与凝血过程相关的

• • 为啥心脏组织跑代谢组峰很少？以及组织和血清样本的前处理

  心脏组织在进行代谢组分析时峰值数量较少的原因可能有多个，包括样本的本质特性、前处理的方法以及分析技术的局限性等。以下是一些可能的解释和对策：   一、原因分析 1.代谢活性和复杂性： 心脏组织主要参与能量代谢，如脂肪酸和糖的氧化，可能会导致检测到的代谢物种类相对单一。   2.样本处理过程中

• • 靶向检测粪便中短链脂肪酸的方法

  靶向检测粪便中短链脂肪酸（SCFAs）的方法通常涉及气相色谱（GC）技术，这是因为气相色谱特别适合于挥发性有机化合物的分析，而短链脂肪酸正是这类化合物。以下是具体步骤和注意事项：   1. 样品收集与准备 样品收集：粪便样本应在收集后尽快处理或冷冻保存，避免微生物活动改变短链脂肪酸的含量。样

• • 脂质代谢组学研究(Lipidomics)中，怎么提取脂质以及分离外泌体

  在脂质代谢组学研究中，提取脂质和分离外泌体是两个关键步骤，下面为您提供了这两个步骤的一些常用技术方法，希望对您有所帮助。一、提取脂质 常用方法有Folch和Bligh-Dyer两种 1.Folch方法：（1）将样本与氯仿和甲醇的混合溶剂（比例为2:1，v/v）充分混合。（2）添加适量的盐水，

• • 数据库查不到差异物质的功能

  建议采取以下几个步骤进一步探索：1.扩大代谢物数据库搜索范围：尝试使用更多的数据库进行查询，特别是那些专注于特定生物种类或具有特定代谢途径数据的数据库。例如，使用专门的植物代谢数据库（如PlantCyc）或微生物代谢数据库（如MicroCyc）可能会找到更多信息。2.跨数据库：代谢物的功能往

• • 筛选出来的差异代谢物质的作用应该去哪里查到比较可靠的结果

  筛选出的差异代谢物质的作用和信息可以通过以下几个途径来查找和验证，以确保结果的可靠性：   1.科学文献数据库： 如PubMed, ScienceDirect, Springer等。这些数据库收录了大量的科学研究论文，是获取最新科学发现和深入理解代谢物质作用的重要来源。   2. 化学物质和