蛋白分析FAQ汇总
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• 在MaxQuant文件中列出的蛋白质特定亚型是唯一被鉴定的亚型吗?
一般报告里给出的是每个蛋白质组的第一个蛋白质。如果要确认其是否是唯一被鉴定的亚型,必须检查MQ_RAW选项卡或MaxQuant“蛋白质组.txt”输出文件,您将看到为一个蛋白质组列出的所有蛋白质。如果一个组列出了多种蛋白质,这意味着所有这些蛋白质都可能存在于样品中,但是无法检测到蛋白质特异性
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将肽冻干或快速抽吸至固体形态,以提高装运期间肽的稳定性。或者,冷冻样品或将其冷藏至4℃,以便冷运液体样品。最小样品量:5-50微克。避免使用洗涤剂、DMSO、甘油和其他非挥发性溶剂。将缓冲液浓度保持在最低水平,因为高盐量会干扰MS中的电离。LC-ESI MS有时可以用于含有少量盐或尿素的样品
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• 是否可以在将样品上样到SDS凝胶上之前用TCA沉淀样品以增加蛋白质浓度?
在上样到1D凝胶之前,存在不同的方法来增加蛋白质浓度,包括透析、微滤、沉淀和色谱。您可以使用TCA沉淀,但TCA是一种强大的酸,可能导致某些蛋白质的水解和碎裂。通常经常使用冰冻的乙醇/丙酮进行沉淀,它在增加蛋白质浓度的同时可去除大多数盐和缓冲液成分。具体做法是将样品与冷冻的乙醇以100 ul
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首先,重要的是要知道2D PAGE的蛋白质样品不应含有高盐浓度,SDS等离子洗涤剂或细胞裂解产生的细胞碎片和DNA。这些会干扰等电聚焦(IEF)并导致凝胶中出现斑点条纹。确保蛋白质浓度约为1-20ug /ul。对于含有许多蛋白质的复杂样品,每个凝胶上的蛋白质上样量应约为50-300微克,纯蛋
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凝胶样品—短1D PAGE:将蛋白质样品加载到1D PAGE凝胶上,仅电泳1厘米(200 V时5-8分钟)。用考马斯染色后,将整个染色区域切除为一个样品(2x5mm凝胶片)并将其送去分析。长1D PAGE:将蛋白质样品加载到 1D PAGE 凝胶上,然后照常电泳。用考马斯染色后,将整个染色区
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样品量:提供>100ul液体材料,最低浓度为0.1ug/ul。固体材料应提供足够的量,以便准确称量样品。样品纯度:我们可以分析大多数含有蛋白质和肽的样品。避免高蔗糖、尿素(>2M)或盐浓度。不要使用含有甘油和大量伯胺(例如 TRIS 或甘氨酸)的缓冲液,因为它可能会干扰茚三酮反应,从而提供特
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通过质谱测定蛋白质需要足够量的蛋白质以获得良好的数据。开发 MRM 定量测定需要纯形式的蛋白质和没有蛋白质的基质样品,该蛋白质与要分析的实际样品的基质相似。因此,请在干净的实验室中准备样品,以避免被人角蛋白污染。 您可以寄送液体或冻干形式的蛋白质样品。1.纯化蛋白质/肽:色谱蛋白质/肽纯度应
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蛋白质样品可以以液体形式或冻干形式寄送。最小量约为20-50微克。避免使用洗涤剂,并将缓冲液浓度保持在最低水平。HPLC可能适用于含有少量盐或尿素的样品。然而,在没有洗涤剂的挥发性溶剂中,缓冲强度低的情况下可以获得最佳结果。1.将样品放入微量离心管中(使用Eppendorf 管或实验室中的类
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通过质谱分析蛋白质需要足够量的纯蛋白质才能获得良好的数据。样品必须在干净的实验室中制备,以避免被人角蛋白污染。蛋白质样品可以以液体或冻干形式寄送。1.纯化蛋白质/肽:色谱蛋白质/肽纯度应为>90%;避免使用洗涤剂,并将缓冲液浓度保持在最低水平。LC-ESI MS适用于含有少量盐和尿素的样品,
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1.冻干或溶液样品均可:2.最小样品量:5-50微克。避免使用洗涤剂、DMSO、甘油和其他非挥发性溶剂。将缓冲液浓度保持在最低水平,因为高盐量会干扰MS中的电离,对于含有少量盐或尿素的样品,有时也可以使用LC-ESI MS。然而,在没有洗涤剂的挥发性溶剂中,缓冲强度低,可获得最佳结果。相关服
How to order?

