蛋白分析FAQ汇总

我们需要至少0-15 ug的高纯度总蛋白（基于考马斯亮蓝染色的SPD-PAGE，蛋白纯度≥80%）样品或20-30ug的低纯度总蛋白（基于考马斯亮蓝染色的SDS-PAGE，蛋白纯度≤50%）样品，以最大限度地提高检测成功率和准确率。相关服务:凝胶及图像分析

通过质谱法对经过胰蛋白酶酶解消化后的蛋白质样品进行磷酸化分析，从而可在肽水平上获得序列信息和磷酸化状态。因此，我们至少可以将磷酸基团定位在几个残基内。如果肽序列上只有一个可磷酸化残基（即只有一个Ser，Thr或Tyr）或磷酸盐的数量等于可磷酸化残基的数量，则可以明确磷酸化的氨基酸位点。如果

LC-MS/MS即液相色谱串联质谱。样品制备过程中产生的肽通过液相色谱（通常为HPLC）根据物理性质（如疏水性或电荷）进行分离。随后，质谱仪测量相应肽的质荷比（m/z），基于此计算肽的分子量。在第二次进行MS检测后，分离目标肽段并进行肽段裂解。由此产生的碎片离子谱、MS / MS图谱中包含有

在鸟枪法（Shotgun）蛋白质组学中，蛋白质被蛋白水解酶消化为肽段。质谱仪一次只能检测有限数量的肽，因此在进行 MS 分析之前，先将复杂的肽混合物在 nano-HPLC 上进行分离。从LC中洗脱得到的肽被喷射到MS中，并在电喷雾电离（ESI）过程中被高压电离为带电分子。电离是必不可少的，

‘# peptides’是蛋白质组中鉴定到的肽序列的总数。相关服务:蛋白质鉴定

并非所有鉴定的多肽都可以唯一地匹配到数据库中的单个蛋白质。例如，蛋白质亚型或同源蛋白质的相同的序列部分就会产生相同的多肽。因此，当一个已确定的肽可能属于多种蛋白质时，这些蛋白质则被划分为一个蛋白质小组。每个蛋白质小组由一个主蛋白质代表，主蛋白质是蛋白样品中最有可能存在的蛋白质（通常具有最高数

载气是用来携带样品的惰性气体。经常使用氦气(He)、氮气(N2)、氢气(H2)和氩气(Ar)。氦气和氮气是最常用的，并且在使用毛细管柱时需要使用氦气。相关服务:蛋白质质谱鉴定

将裂解物储存在-80℃，以防止裂解物中存在的磷酸酶降解磷酸化蛋白。相关服务:磷酸化定量蛋白组学研究

使用磷酸酶和蛋白酶抑制剂，并将样品放在冰上，以在样品制备过程中抑制蛋白质降解并保护翻译后修饰。相关服务:磷酸化定量蛋白组学研究

分析色谱用于确定样品中分析物的存在以及可能的浓度。例如，通过尺寸排阻色谱估计抗体样品中的聚集体/二聚体含量。制备色谱用于纯化足够量的物质以供进一步使用，例如用于功能或结构研究。相关服务:蛋白质质谱鉴定

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