蛋白分析FAQ汇总

• • SWATH定量—用于SWATH 分析的离子库是如何生成的？这种采集方法还有其他名称吗？ 它与鸟枪蛋白质组学或 MRM 相同吗？

  离子库是由数据依赖采集（DDA）生成的，也可以称为信息依赖采集（IDA）。这种采集模式是用来做shotgun蛋白质组学的，但和MRM模式不一样。MRM 模式用于分子或肽的靶向定量，在离子库的生成中没有用处。相关服务:SWATH定量蛋白组学服务

• • SWATH定量—SWATH采集通过依次分析窗口来获取数据。通常情况下，数据是如何获取的？

  通常情况下，或在IDA模式下，数据是在调查扫描后获得的。调查扫描确定了40个最强的离子，并且只对这些离子进行破碎。这意味着在固定的时间点，唯一被碎片化的离子是选定的最强烈的离子。在SWATH的1个周期内，所有窗口都是按顺序获取的。例如：假设我们想要覆盖从 350-1250 m/z 的一系列离

• • 组蛋白如何进行翻译后修饰？

  组蛋白翻译后修饰是通过丝氨酸或苏氨酸残基的磷酸化，赖氨酸或精氨酸的甲基化，赖氨酸的乙酰化和去乙酰化，赖氨酸的泛素化和赖氨酸的sumo化来对组蛋白进行共价修饰。相关服务:翻译后修饰蛋白组分析

• • 什么是乙酰化修饰？

  乙酰化是细胞生物学中蛋白质的一种重要修饰；蛋白质组学研究已经确定了数千种乙酰化的哺乳动物蛋白质。乙酰化作为蛋白质（例如组蛋白、p53和小管蛋白）的共翻译和翻译后修饰发生。相关服务:乙酰化定量蛋白组研究

• • 乙酰化的过程是什么？

  乙酰化是将一个乙酰官能团（乙酰氧基，CH3CO）引入有机化合物的反应（即用乙酰基取代氢原子），而去乙酰化是从有机化合物中去除一个乙酰基的反应。相关服务:乙酰化定量蛋白组研究

• • 你们如何评估翻译后修饰？

  使用质谱检测翻译后修饰。质谱可以检测几乎所有的PTMs，也可用于识别未知的PTMs。蛋白质中的共价修饰会影响修饰氨基酸的分子量，因此通过MS可以检测到质量的差异。相关服务:翻译后修饰蛋白组分析

• • 蛋白质翻译后修饰最常见的两种检测方法是什么？

  蛋白质翻译后修饰可以通过多种技术进行实验检测，包括质谱、Eastern blotting和Western blotting。相关服务:翻译后修饰蛋白组分析

• • 蛋白质的翻译后修饰在哪里发生？

  翻译后修饰发生在内质网中，包括折叠、糖基化、多聚体蛋白质组装和蛋白水解裂解，它们使蛋白质成熟和活化。一旦生长的肽出现在内质网中并暴露于修饰酶时，它们就会发生。相关服务:翻译后修饰蛋白组分析

• • 质谱法可以提供关于蛋白质翻译后修饰的哪些信息？

  一个PTM的存在将改变修饰氨基酸残基和肽的质量。MS/MS通常揭示PTM的质量以及所修饰氨基酸残基的身份和位置。MS/MS是一种灵敏且快速的肽测序技术。相关服务:翻译后修饰蛋白组分析

• • HPLC—反相（RP）HPLC 和疏水相互作用色谱（HIC）有什么区别？

  在这两种情况下，固定相都比流动相更疏水。RP-HPLC固定相的疏水性通常高于HIC。RP-HPLC中的洗脱是通过用水溶性溶剂（例如醇或乙腈）调节流动相的极性而实现的。洗脱在等度（恒定的改良剂浓度）或梯度条件下（增加改良剂浓度）下进行。HIC固定相疏水性较弱，且通过降低盐浓度从而降低流动相中的