蛋白分析FAQ汇总

• • 凝胶内的蛋白样品是否可以长期保存？

  如果保存时间超过一周，可以将蛋白条带切取后放入-20℃或者-80℃冰箱保存；如果小于一周，则可以常温保存。相关服务:凝胶及图像分析

• • 凝胶内的蛋白样品如何运输？

  一般将样品常温快递运送即可。相关服务:凝胶及图像分析

• • 凝胶内的蛋白样品对质谱鉴定有何影响？

  基本不会影响后续质谱鉴定效果。相关服务:凝胶及图像分析

• • iTRAQ/TMT技术相对于电泳技术有什么优势？

  相较于2-DE以及DIGE等基于电泳的技术，iTRAQ/TMT分辨率高，可提供成百上千的蛋白定性定量信息；其次通量高，可一次性对多个样品进行试验，特别适合于多组样品间的同时比较以及生物学过程的动态检测。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT， SILAC

• • iTRAQ/TMT实验的主要步骤有哪些？

  主要步骤包括蛋白提取、浓度及纯度测定、蛋白酶解、同位素标记、高效液相色谱分离、高分辨LCMSMS质谱检测、搜库定性定量分析、差异蛋白筛选、差异蛋白生信分析以及中英文结题报告整理。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT， SILAC

• • iTRAQ/TMT实验主要采用哪些仪器？

  目前常用于iTRAQ/TMT实验的质谱仪主要有AB 5600 Triple TOF和Thermo Q Exactive Orbitrap等。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT， SILAC

• • iTRAQ/TMT实验数据可做那些生物信息分析？

  数据分析包括：差异蛋白质统计分析（火山图、韦恩图、热图、聚类等）、GO/COG功能注释及富集分析、KEGG通路注释及富集分析、差异表达蛋白聚类分析以及PPI网络分析等相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT， SILAC

• • iTRAQ/TMT实验的中“组分”或者“SCX分级”代表什么？

  iTRAQ/TMT实验对肽段进行的是二维LC-MS分析，其中第一维的色谱分析主要采用的是SCX或者高pH值的HPLC将标记好的肽段混合样品初步分离成10个组分，以此来达到降低每个组分中肽段样品的复杂程度，“组分”或“SEC分级”指的就是这种一维分级。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTR

• • 可以采用什么软件分析iTRAQ的下机原始数据？

  一般采用与AB 5600 Triple TOF质谱配套的proteinpilot 5.0v软件进行后续的质谱数据分析，proteinpilot 5.0v在蛋白质组定性定量鉴定中被广泛认可，已有大量学者利用该软件分析数据并发表了相关文献。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT，

• • 如何根据iTRAQ的下机原始数据如何筛选差异蛋白？

  目前还没有统一的标准来筛选差异蛋白，为了有利于后续的生信分析，实际筛选中一般将每组的差异蛋白总数控制在200左右，或者在所鉴定的蛋白总数的10%左右。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT， SILAC