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TMT技术是由美国Thermo公司研发的一种化学标记技术,其采用同位素标签特异性标记酶解后获得的蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基团,之后使用质谱对蛋白进行相对定量检测。TMT定量蛋白质组学分析指采用TMT技术对细胞、组织或生物体中的所有蛋白质进行相对定量分析,是一种基于质谱分析的测定不同样品中蛋
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纯化的蛋白在进入质谱分析前,通常需要将纯化的蛋白样品经过蛋白酶的酶切消化为肽段混合物,再经过高效液相色谱对多肽片段进行初步分离,以进一步提升质谱检测的准确度。液相色谱不受蛋白样品挥发性、热稳定性及相对分子质量的限制,仅要求将蛋白样品制成溶液即可,在质谱分析前加了液相色谱分离这一步骤,可使得纯
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蛋白的生理功能通常是通过蛋白与蛋白之间的相互作用来实现的,与靶向目标蛋白发生相互作用的蛋白称之为互作蛋白,互作蛋白的筛选是蛋白相互作用及其功能研究的基础。互作蛋白的筛选方法主要可分为体外(in vitro)和体内(in vivo)筛选,体外筛选包括Pull-down和蛋白质交联(cross
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未知蛋白的互作预测主要通过质谱检测和基于计算机生物信息学方法进行预测,首先将未知蛋白经过蛋白免疫印迹(Western blot)、免疫共沉淀(Co-IP)、SDS-PAGE等方法进行分离纯化,之后进入质谱检测获得未知蛋白氨基酸序列信息。将未知蛋白氨基酸序列输入数据库预测互作蛋白,利用计算机生
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TMT技术是采用同位素试剂标记的方法,使用同位素标签标记蛋白酶解后产生的多肽,之后通过串联质谱检测,针对两个或多个蛋白样本展开相对定量分析。其中,TMT同位素标签化学结构由质量报告基团(Mass Reporter)、氨基反应基团(Amine-reactive Group)和质量平衡基团(Ma
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蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)几乎参与所有的的生物学过程,研究PPI是解析相互作用蛋白的作用机制及其生理功能的基础,互作蛋白组也是目前蛋白质组学研究的重要内容。目前为止,基于质谱(MS)技术的互作蛋白组分析已经成为鉴定PPI的重要技术,其中以亲和纯化结合质谱分析(AP-MS)是目前应用最广
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TMT(Tandem Mass Tag)是一种由美国Thermo公司开发的多肽体外标记技术,其常用于差异蛋白研究以及蛋白相对含量测定。TMT蛋白质组是一种使用TMT标签对样品蛋白进行标记并混样上机的一种蛋白质组检测方法,一次性最多能实现对16个样本的检测。TMT蛋白质组学是采用体外标记的方法
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蛋白质交联是一种结合使用特定的蛋白交联剂和质谱(MS)检测来揭示蛋白质和相互作用蛋白质复合物的结构特征的方法,该方法促进了蛋白相互作用分析中已建立方法和生物信息学工具的发展。蛋白交联度是指蛋白交联后相邻两个交联点的平均相对分子质量,蛋白交联度是表征蛋白交联程度的关键指标,可采用溶胀平衡法和动
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交联是由两个或多个分子通过共价键化学耦联的过程,交联剂是由连接臂和两个对特定氨基酸侧链具有反应性末端的官能团组成。蛋白质分子内交联是指蛋白质内的两个及以上肽链之间通过共价键连接的过程,蛋白质分子内交联连接可通过添加小分子交联剂进行共价耦联来实现。进行分子内交联后的蛋白分子进行蛋白酶水解后,可
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肽质谱分析原理是基于鸟枪法(Shot-gun):将蛋白肽段酶切为小分子肽段混合物,经高效液相色谱(HPLC)分离纯化后导入高分辨率质谱仪分析。肽段在质谱仪中经离子化后将会带上一定量的电荷,通过检测器分析即可获得肽段的质荷比(m/z),进而计算肽段的相对分子质量。
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