未知蛋白互作预测
未知蛋白的互作预测主要通过质谱检测和基于计算机生物信息学方法进行预测,首先将未知蛋白经过蛋白免疫印迹(Western blot)、免疫共沉淀(Co-IP)、SDS-PAGE等方法进行分离纯化,之后进入质谱检测获得未知蛋白氨基酸序列信息。将未知蛋白氨基酸序列输入数据库预测互作蛋白,利用计算机生物信息学技术制作未知蛋白相互作用网络,筛选获得与未知蛋白发生相互作用的关键互作蛋白。未知蛋白互作预测一方面可以探索通过敲除或过表达互作蛋白后检测下游信号通路或相关表型的变化来探索蛋白互作的功能,另一方面可探索蛋白互作的机理,即探索未知蛋白互作是通过蛋白的哪些结构域实现的。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion质谱平台,Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,提供蛋白质互作分析服务,及后续基于液质联用技术(LC-MS/MS)对IP、Co-IP样品及GST融合蛋白Pull-down等纯化样本中的蛋白/蛋白混合物的质谱鉴定分析服务。您只需告知我们您的实验目的并寄出样品,我们将负责项目后续所有事宜,包括细胞培养、细胞标记、蛋白提取、抗体IP、效率检测、蛋白酶切、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析。
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