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鸟枪蛋白质组学(Shotgun Proteomics)是当前生命科学研究中广泛应用的一种全蛋白组识别策略。该方法通过将样本中所有蛋白质酶解成肽段,结合液相色谱与高分辨率质谱,实现对复杂体系中蛋白质的系统性检测与定量。本文将系统分析鸟枪蛋白质组学的关键优势与固有局限,帮助研究者合理选择技术路径
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蛋白质组学已成为理解生命系统功能、探索疾病机制和发现生物标志物的重要工具。然而,复杂样本——如组织切片、血浆、类器官或宿主-病原共培养体系——在蛋白种类、丰度、背景干扰等方面都具备显著挑战。如何在这些样本中获得全面、准确、可重复的蛋白质信息,是当前蛋白质组研究中的关键课题。高通量鸟枪蛋白质组
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在药物发现与机制研究的早期阶段,传统的高通量筛选(HTS)方法虽然能从上万种小分子中识别活性化合物,却难以回答一个关键问题:“它是如何发挥作用的?”这正是活性位点标记的蛋白质组学技术——活性基团标记的蛋白质谱分析(Activity-Based Protein Profiling, ABPP)
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• Shotgun Proteomics vs. Targeted Proteomics:研究选择指南
在蛋白质组学研究中,质谱技术已成为解析生命系统复杂性的重要工具。特别是Shotgun Proteomics(发现型蛋白质组学)与Targeted Proteomics(靶向蛋白质组学)两种主流策略,其技术原理、应用场景和数据特性各异,直接影响实验设计与结果解读。本文将系统比较这两类方法,帮助
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鸟枪法(Shotgun Proteomics)因其高通量和无偏性,已成为蛋白质组学研究的主流策略之一。然而,质谱采集之后的数据分析流程常成为初学者的主要挑战。面对众多工具平台、数据格式和分析逻辑,新手科研人员常常感到无从下手。本文聚焦于适合初学者的鸟枪蛋白质组数据分析工具,覆盖从原始数据处理
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在生物学研究中,我们常通过蛋白组学测定酶的表达水平来判断其功能状态。然而,酶的表达丰度≠活性状态。酶可能以失活形式存在,受到抑制剂调控,或通过翻译后修饰调节其功能。因此,“酶活性”才是反映其真实功能状态的关键指标。ABPP(Activity-Based Protein Profiling,基
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在多组学数据日益丰富的今天,表达组学(Transcriptomics) 依旧是揭示基因调控机制的主力手段之一。通过RNA-Seq等技术,研究者可以全面掌握基因在不同条件下的转录表达情况。然而,这种“表达即功能”的逻辑推演,正面临一个难以回避的盲区:转录水平的变化并不等于蛋白的活性状态发生了变
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多肽测序(Peptide Sequencing)技术,是指通过实验手段确定多肽分子中氨基酸的排列顺序(即一级结构)以及可能存在的翻译后修饰(PTMs)的关键技术。通过该项技术,科研人员可确定多肽中氨基酸的线性顺序(一级结构);定位翻译后修饰(PTMs),揭示蛋白功能调控机制;而 MS/MS(
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多肽(peptides)作为连接蛋白质功能与生命活动的关键中介,在疾病标志物发现、免疫治疗靶点筛选、天然产物研究等领域发挥着日益重要的作用。多肽测序技术是指用于确定多肽分子中氨基酸排列顺序的一类分析方法。多肽由20种标准氨基酸通过肽键连接形成,序列的不同决定了其生物学功能、稳定性以及与靶标的
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活性基蛋白质组学(Activity-Based Protein Profiling, ABPP)是一种以功能为导向的蛋白质组研究技术,能够特异性捕获细胞或组织中处于活性状态的酶类蛋白。ABPP不仅能提供蛋白表达信息,还能反映其真实功能状态,是酶类靶标发现、药物作用机制解析、疾病标志物筛选的关
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