定量乙酰化蛋白质组学介绍：适用样本、流程与交付内容
蛋白质乙酰化是一种广泛存在于真核生物中的可逆翻译后修饰（PTM），在调控染色质结构、代谢通路、细胞周期以及信号转导等生物过程中发挥关键作用。通过高分辨率质谱技术，系统性地鉴定和定量蛋白质乙酰化位点，为解析表观遗传机制和疾病发生机制提供了重要手段。本文将围绕定量乙酰化蛋白质组学适用样本类型、实验流程与数据交付内容三方面，全面介绍定量乙酰化蛋白质组学的关键要素，帮助科研人员更高效地开展相关研究。
一、定量乙酰化蛋白质组学是什么？
蛋白质乙酰化修饰主要发生在赖氨酸残基（Lysine, K）上，调节蛋白质的稳定性、亚细胞定位和与其他分子的相互作用。传统Western blot检测能力有限，而定量乙酰化蛋白质组学则通过抗体富集结合LC-MS/MS技术，支持大规模、全局性修饰位点的定性+定量分析。
1、常见定量策略包括：
（1）标记方法：如TMT（Tandem Mass Tags）、iTRAQ，适用于多组样本并行分析。
（2）非标记法（Label-free）：无需标记，适用于样本量有限或预算受限场景。
二、定量乙酰化蛋白质组学适用样本类型
定量乙酰化蛋白质组学可适用于多种生物样本，涵盖从基础研究到临床转化的多个研究方向：
1、常见样本类型及应用场景如下：
2、定量乙酰化蛋白质组学样本处理建议：
（1）推荐使用新鲜样本或-80°C冷冻保存；
（2）避免反复冻融，最大程度保留修饰状态；
（3）使用含去乙酰化酶抑制剂的裂解液，以防修饰丢失。
百泰派克生物科技已建立多种样本类型的标准化处理方案，确保乙酰化修饰的完整性和实验结果的可比性。
三、定量乙酰化蛋白质组学实验流程概览
定量乙酰化蛋白质组学实验主要包括四大步骤，具体如下：
1、蛋白提取与酶解
（1）样本裂解缓冲液中添加抑制剂（HDACi），防止修饰损失；
（2）蛋白定量后，使用胰蛋白酶进行充分酶解。
2、肽段纯化与修饰富集
（1）采用高亲和力的抗乙酰赖氨酸抗体进行修饰位点富集；
（2）洗脱并脱盐处理，得到富集肽段。
3、液相色谱-质谱联用（LC-MS/MS）分析
（1）采用高分辨率质谱平台，如Orbitrap Exploris 480；
（2）根据项目需求选择DDA或DIA模式进行数据采集。
4、数据分析与定量
（1）使用MaxQuant、PD等软件进行肽段鉴定与定量；
（2）乙酰化位点水平的统计分析（fold change、p值）；
（3）通路富集（KEGG、GO）、聚类热图等可视化展示。
四、定量乙酰化蛋白质组学数据交付内容
百泰派克生物科技为确保科研人员顺利使用数据，提供完整、规范的交付资料：
1、原始数据
（1）质谱原始文件（.raw）；
（2）参考数据库（FASTA）等基础信息。
2、定量结果表格
（1）乙酰化位点及对应蛋白的定量表达矩阵；
（2）包含p值、fold change、肽段信息等。
3、生物信息学分析报告
（1）GO、KEGG、Pfam等功能注释与通路分析；
（2）聚类分析、差异位点筛选等统计结果；
（3）丰富的图件：火山图、热图、通路网络图等。
4、PDF实验总结报告
（1）实验流程与参数记录；
（2）质控指标与分析结论；
（3）数据使用建议。
5、可选个性化交付
（1）蛋白互作网络构建（PPI）；
（2）多组学联合分析（转录组+蛋白组+修饰组）；
（3）文章图表润色与技术支撑。
五、定量乙酰化蛋白质组学应用方向与研究案例
1、表观遗传机制研究：乙酰化修饰与组蛋白调控、染色质开放性等相关研究
2、代谢重编程分析：线粒体蛋白乙酰化在氧化磷酸化过程中的调节作用
3、肿瘤及免疫研究：免疫检查点、炎症反应中乙酰化修饰的动态变化
4、药物靶点验证：评估小分子药物对乙酰化酶类活性或靶点修饰的影响
六、百泰派克生物科技的服务优势
1、技术平台先进
（1）配备Orbitrap Exploris 480、QE HF等高端质谱仪器
（2）兼容DIA、DDA、PRM等多种数据采集模式
2、服务流程专业
（1）从样本制备、质谱分析到生信挖掘全流程覆盖
（2）严控数据质量、保证分析重复性
3、数据解读能力强
（1）配套可视化图表支持论文撰写
（2）提供分析指导和图注解释，助力成果快速发表
4、响应及时、交付高效
（1）实验周期可控，适配项目申报与临床时间节点
（2）支持项目加急处理与阶段性交付
定量乙酰化蛋白质组学已成为研究细胞表观调控机制的重要工具。通过高分辨率质谱与富集技术的结合，科研人员可以系统性识别关键乙酰化位点，揭示疾病发生发展中的调控网络。百泰派克生物科技依托先进质谱平台与标准化流程，致力于为广大科研工作者提供可靠、高效、可发表的数据支持。如您有相关研究需求，欢迎联系我们的技术团队获取方案建议！
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