蛋白分析FAQ汇总

• • 请问有S-亚硝基化分析的protocol吗？

  一下是一份简化的S-亚硝基化蛋白分析protocol： 材料和试剂 目标蛋白质样品 缓冲溶液，例如PBS（磷酸盐缓冲盐水） 蛋白质提取试剂 蛋白质浓度测定试剂，例如BCA蛋白定量试剂盒 还原剂，如DL-二硫苏糖醇（DTT） 烷基化剂，如碘乙酰胺（IAM） 胰蛋白酶或其他蛋白酶 质谱仪（例

• • 做质谱分析得到了可能互作的蛋白，这个结果可以用什么图呈现到论文中

  质谱分析得到的可能互作蛋白可以通过多种图形展示，以下是几种常用的图形呈现方法：   1.互作网络图（Protein Interaction Networks）： 这是最直观的展示方法之一，可以清楚地显示蛋白质之间的互作关系。每个节点代表一个蛋白质，而节点之间的连线表示蛋白质之间的

• • 多肽合成之后到鉴定，已用生信法预测某序列的功能，如果多肽具有生物活性比如说抗凝血，可以直接用aptt试剂盒检测吗？

  可以，如果多肽具有潜在的抗凝血功能，可以使用活化部分凝血活酶时间（APTT）试剂盒进行直接检测。APTT试验是一种常用的血液凝固测试，能评估体内的凝血途径是否正常，特别是内源性凝血途径。通过测量在特定条件下血浆凝固所需的时间来评估抗凝血因子的影响，因此它非常适合用于评估多肽等小分子化合物的抗

• • 多肽合成之后到鉴定怎么做呢？现已用生信的方法预测了某序列的功能，想后续验证一下

  后续的验证可以参考一下几个方面： 1.多肽鉴定： 质谱分析（Mass Spectrometry, MS）：用于确定多肽的分子质量，确认合成的多肽与预期的一致。 氨基酸序列分析：通过串联质谱（MS/MS）分析多肽的氨基酸序列，确保序列正确无误。 液相色谱（HPLC）：

• • IP-MS和Co-IP MS有什么区别吗

  IP-MS（免疫共沉淀质谱分析）和Co-IP MS（共免疫共沉淀质谱分析）都是研究蛋白质相互作用的技术，主要区别在于目标蛋白质的选择和识别过程： 1.IP-MS： 先通过特异性抗体与目标蛋白质结合，形成抗体-蛋白质复合物，然后通过沉淀这些复合物，再利用质谱技术对沉淀物中的蛋白质进行鉴定。这

• • 差异表达蛋白质统计分析中，怎么知道最显著的那个蛋白是什么？

  要确定哪个蛋白质在差异表达分析中最显著，关键在于查看统计分析的结果。具体来说可以： 1.查看调整后的P值： 统计分析结果通常会列出每个蛋白质的调整后P值。最显著的蛋白质是那个具有最低调整后P值的蛋白。 2.考虑表达量变化幅度： 对于具有最低P值的蛋白质，还需考虑其表达量变化的幅度（如

• • WB膜可以质谱吗？

  是的，Western Blot（WB）膜上的蛋白质可以用于质谱分析。在Western Blot过程中，蛋白质被转移到PVDF或硝酸纤维素膜上，之后这些蛋白质可以从膜上切下，再进行酶解，最后进行质谱分析以确定蛋白质的身份或进行进一步的表征。 百泰派克生物科技--生物制

• • 交联法蛋白相互作用分析中，使用交联剂处理细胞后要用loadingbuffer然后煮吗？

  是的，在交联法蛋白相互作用分析中，提取蛋白后通常需要加入loading buffer，并进行煮沸处理。这个步骤是为了使蛋白质变性，以便于后续进行SDS-PAGE电泳分析。 百泰派克生物科技--生物制品表征，多组学生物质谱检测优质服务商 相关服务： 交联法蛋白相互作用分析 蛋白质相互作用分

• • 有了多肽序列，怎么检测这个多肽可不可用？

  检测多肽的可用性通常涉及对其生物学性质、稳定性、纯度和功能性的评估： 1.纯度检测： 高效液相色谱（HPLC）：用于检测多肽的纯度，即多肽样品中目标多肽的百分比。 质谱（MS）：用于确定多肽的分子质量，进一步确认其纯度和结构。 2.生物活性检测： 体外实验：如酶抑制测定、受体结合实

• • 交联法蛋白相互作用分析中，使用交联剂处理细胞后要用ripa裂解吗

  在交联法蛋白相互作用分析中，使用交联剂（如甲醛或双硫仑）处理细胞后，通常需要用RIPA缓冲液或其他蛋白裂解液进行裂解。这一步骤是为了破坏细胞膜和释放细胞内的蛋白质，使之能够在后续的分析中被检测。RIPA缓冲液能有效地裂解细胞和组织，释放蛋白质，并保持交联的蛋白质复合物稳定。 百泰派克生物科