蛋白分析FAQ汇总

• • 各种蛋白都可以用iTRAQ技术进行定量吗?

  理论上任意来源的蛋白只要符合要求都可以进行iTRAQ定量，包括各种动植物、微生物、细菌和病毒蛋白等。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT， SILAC

• • 一次iTRAQ实验一般能鉴定到多少蛋白？

  iTRAQ实验一次可同时检测8个样品，一般可以鉴定到3000～5000个蛋白，具体需根据您的样本而定。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT， SILAC

• • 如何选择iTRAQ和Lable-free技术？

  iTRAQ标记定量利用标签标记多肽，提高了肽段的离子化效率和可鉴定到的蛋白质数量，基于低分子量端进行定量提高了定量的准确性，且可同时检测多达8种样品；Lable free非标定量不受样本条件限制，基于一级质谱数据对多肽进行定量，对质谱仪的重复性和稳定性要求挺高。iTRAQ在实验周期以及准确度

• • 如何判断差异蛋白？

  差异蛋白通常需要借助差异倍数和P值两个参数来确定，一般当两种蛋白的差异倍数达到1.3-2倍且统计检验的P值小于0.05时即视为差异蛋白。相关服务:差异表达蛋白质统计分析

• • Label-free定量的原理？

  Lable free非标记定量通过质谱检测到的肽段离子峰强度以及质谱的分析次数来进行定量，肽段离子的丰度与其被质谱检测到的次数成正比，通过两者关系的数学公式将质谱计数与肽段含量联系起来而对肽段进行定量。相关服务:基于LABEL FREE的定量蛋白组分析

• • Label-free定量技术的优劣是什么？

  Label free的优势在于不需要标签标记，操作简便，价格便宜，且不受样本数量限制。但缺点也随之而来，那就是Label free的定量准确性不如标记定量好，对质谱仪器的性能要求和实验操作的稳定性和重复性较高。相关服务:基于LABEL FREE的定量蛋白组分析

• • Label-free为什么不受样本数量限制？

  主要是因为Lable free不使用同位素标签标记样品，样本内不含同位素标签，样本内的蛋白被酶解后依次进行色谱分离和质谱鉴定，根据质谱下机数据如肽段离子峰进行定量。因此Lable free不受样本类型和数量限制。相关服务:基于LABEL FREE的定量蛋白组分析

• • 为什么Label-free定量的准确性较低？

  因为Label-free非标定量根据一级质谱数据进行定量，由于样本过于复杂，肽段产生的相近的m/z太多，无法有效进行区分，所以导致离子峰面积提取异常和定量不准。相关服务:基于LABEL FREE的定量蛋白组分析

• • HPLC分级的作用是什么？

  HPLC分级可以降低样本中蛋白的复杂程度而提高每个组分中某种蛋白的丰度，有利于后续的质谱分析。相关服务:蛋白质纯度分析（分子筛/反相色谱）

• • HPLC是否组分越多越好？

  并不是，组分越多即分级越多时，会降低组分中蛋白的丰度，不利于质谱鉴定，而分级数太少又达不到降低蛋白复杂程度的要求。相关服务:蛋白质纯度分析（分子筛/反相色谱）