蛋白分析FAQ汇总
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我们更喜欢考马斯染色凝胶,但接受用质谱兼容的银染料染色的凝胶。通过我们之前的经验,银染凝胶通常不会比考马斯染色凝胶获得更好的结果。这可能归因于由于过程中使用的显影剂(例如甲醛和戊二醛等)引起的蛋白质内和蛋白质与凝胶的交联。相关服务:蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定
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• 我对蛋白质的翻译后修饰很感兴趣。我可以通过质谱获得我的蛋白质的完整序列覆盖吗?
大多数蛋白质很难完全覆盖。这取决于良好消化蛋白质的能力,可能受到蛋白质折叠、蛋白酶切位点和样品复杂性的影响。丰度、纯度、蛋白质序列、疏水性和抑制消化的蛋白质修饰(如糖基化)等都会影响覆盖率。使用不同的酶和使用多种策略分析蛋白质将增加覆盖率。相关服务:翻译后修饰蛋白组分析
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通常,完整的分析需要 10 皮摩尔的 picomole/ul 的浓度。它在很大程度上取决于蛋白质的纯度、样品的复杂性(即存在的不同蛋白质的数量)和蛋白质的分子量。为了使完整的蛋白质分析成功,蛋白质样品不能含有任何聚合物或去污剂(即使含量极低),并且通常样品在制备过程中的任何时候都不能接触去污
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负染色技术(如锌染色)与质谱法兼容。许多荧光染料也与质谱相容相关服务:蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定
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不可以,请在运输前冷冻干燥以确保最大稳定性。相关服务:氨基酸组成分析
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我们的 HPLC 检测限为每次进样 500 pmole。因样品处理限制,所以需要 nmoles 的目标肽。对于蛋白质,需要这个量的 10-100 倍。相关服务:氨基酸组成分析
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样品的纯度至关重要。这实质上意味着需要 100% 的蛋白质纯度才能获得准确的结果。10% 的蛋白质污染就会破坏您的最终结果。蛋白质、氨基酸、缓冲液和盐的污染会干扰分析。必须去除含有伯胺和仲胺的缓冲液,例如甘氨酸、Tris、HEPES 和甘油。这些物质可以通过乙醇沉淀、三氯乙酸沉淀、反相萃取、
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半胱氨酸和色氨酸不能通过常规酸水解来分析。它们在水解过程中会被破坏,因此需要特殊的水解方法。相关服务:氨基酸组成分析
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请说明您是否需要半胱氨酸和色氨酸分析。天冬酰胺和谷氨酰胺在蛋白质酸水解过程中 100% 转化为天冬氨酸和谷氨酸,因此无法在蛋白质样品中独立测量。相关服务:氨基酸组成分析
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蛋白质组装:在这里,所有独特和非独特的肽都被简约分配给单个蛋白质,并且蛋白质被聚合(即多个异构体坍缩成一个条目,除非有存在一个以上异构体的独特证据)。生成的蛋白质列表代表了在应用任何定量过滤器之前识别的所有蛋白质。 蛋白质定量:为了提高数据质量,我们在量化级别应用了两个过滤器。1)S/N 阈
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