质谱是如何鉴定蛋白质的？

首先用胰蛋白酶将蛋白质消化成肽，然后将每个肽离子片段在质谱仪中单独分析。这个过程通过断开氨基酸将每个肽片段化，将质谱得到的碎裂光谱与数据库使用Mascot搜索算法查找相同的氨基酸序列。该方法可以识别已知的蛋白质以及与其密切相关的蛋白质。

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