除了样本,我还需要为数据分析步骤提供什么?
对于每个质谱分析,都需要一个蛋白质 fasta 文件。如果您使用的是非模式生物,向我们提供来自公共数据库(如 NCBI 或 uniprot)或自测序和注释的蛋白质 fasta 文件将非常有帮助。如果没有可用的,请在启动会议上告诉我们,我们可以讨论数据分析的可能选项。此外,如果您向我们提供有关您对蛋白质翻译后修饰发生敢兴趣的任何信息,或者您的项目是否对区分特定的蛋白质异构体等很重要,这将很有帮助。此外,还请给我们提供对数据分析很重要的样本信息。通常,我们需要比较来自两个或多个不同组的样品的蛋白质丰度。为此,我们需要知道哪些样本属于哪个组。如果样本描述表中已经提供了信息,那就太好了。
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