蛋白分析FAQ汇总

• • 什么是酵母双杂交 (Y2H) 检测？

  在酵母双杂交 (Y2H) 测定中使用两种蛋白质，一种与 DNA 结合域或 DBD 结合，第二种蛋白质与激活域或 AD 结合，也称为 Pry 蛋白。如果蛋白质彼此相互作用，则 DBD 和 AD 结构域相互作用，并且位于报告基因上游的转录因子变得活跃。这种方法是一种节省成本的直接的蛋白质相互作用

• • 搜索参数中包括哪些翻译后修饰类型？

  氧化是一种可变修饰，因为它可以在电泳过程中发生。其他翻译后修饰不包括在搜索参数中，因为它们大大降低了分析的统计能力。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 质谱数据报告末尾的未分配肽有用吗？

  报告末尾的未分配肽不应视为从头测序的肽序列。Mascot软件不用于对这类肽的光谱进行测序，因此推断出的氨基酸序列不予公布。这些光谱应仅被视为存在其他肽的证据，可以通过专门的从头测序软件进行分析。相关服务:从头测序

• • 可以访问原始质谱数据吗？

  可以从网页链接和服务器下载原始数据。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 如何重新分析质谱数据？

  可以从在线结果获得质谱数据。如果需要，客户端可以使用不同的参数重新搜索。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 什么是从头测序？

  从头测序技术根据质谱原理使用专业软件确定氨基酸序列。该技术可以很容易地提供足够的数据以显示样品蛋白与其他蛋白质或新蛋白质的同源性，以获得内部氨基酸序列信息，从而能够克隆该基因。相关服务:从头测序

• • 什么情况需要进行从头测序？

  当公共数据库中没有所测物种的基因组数据时就只能采取从头测序的方式。相关服务:从头测序

• • 什么长度的肽可以从头测序？

  含6-15个氨基酸的肽可以获得最佳序列。如果多肽的量够多的话，则较长的序列（15-20+）也是可能进行测序的。相关服务:多肽从头测序

• • 如何解释从头测序结果？

  第一个序列（Rank 0）被认为是MS质谱的最可能解释，但排名较低的序列也可能是合理的解释。进行从头序列分析后，客户必须进行BLAST（http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi）搜索，以寻找与生物相关蛋白的同源性。BLAST搜索的目的是从数据库中寻找同源

• • 从头测序需要多少样品？

  通常需要10ng-100ng纯蛋白。对于冻干或粉末样品，需要50µg样品。相关服务:从头测序