蛋白分析FAQ汇总

• • MRM定量质谱时一次可以监测多少个蛋白？

  一般情况下，MRM可同时检测200对transition，大概20-40个蛋白，但实际还要看蛋白样品的丰度以及复杂程度等。相关服务:MRM/PRM定量蛋白组学分析

• • 不知道蛋白质的信息能否进行MRM实验？

  进行MRM必须明确知道目标蛋白质，并获得蛋白质的全序列。相关服务:MRM/PRM定量蛋白组学分析

• • 只有物种的基因组信息，能否进行MRM？

  有基因组信息一般都会有预测的蛋白序列库，也可以根据基因组信息先翻译成氨基酸序列再进行MRM。相关服务:MRM/PRM定量蛋白组学分析

• • 质谱分析中的母离子对是怎么选择的？

  母离子对是通过LC-MS/MS产生的谱图库筛选经软件设定再通过实验优化获得的。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 一个子离子是否会对应多个母离子，怎样保证特殊性？

  一个子离子可能对应多个母离子，可以通过MRM的全谱扫描分析出子离子唯一对应的母离子。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 什么时候进行母离子对筛选的参数设定？

  在样品进入质谱仪之前就需要设定并调试好母离子的筛选条件。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 如何设定母离子对？

  先通过谱图库筛选到得到母子离子对，设定参数，进行质谱鉴定，若出现的谱图显示捕捉到目的肽段，那就可以适用，若不行，重新设定，这样不断的反复验证筛选获得最适的母子离子对相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • MRM定量有哪些优势？

  通量高（能实现大规模样本的定量分析）、特异性强（无非特异性交叉反应）、定向性好（可去除背景噪音定向研究目的蛋白）。相关服务:MRM/PRM定量蛋白组学分析

• • 双向凝胶电泳联合质谱鉴定蛋白质的大致步骤有哪些？

  1、首先电泳谱图进行扫描找到差异点；2、然后将靶点进行脱色、酶解、色谱分离、质谱检测，得到质谱原始数据文件，3、最后通过数据库搜索可以得到差异点中的蛋白质的详细信息。相关服务:蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定

• • 磷酸化蛋白质组富集策略有哪些？

  抗体沉淀法、亲和富集法、色谱分离富集法（IMAC富集法、金属氧化物和金属氢氧化物富集方法、阴阳离子交换富集法以及亲水性相互作用色谱法）等。相关服务:磷酸化定量蛋白组学研究