蛋白分析FAQ汇总

1、BLAST序列比对可以检索到与目标蛋白同源的蛋白质，根据相似蛋白可能具有相似功能的原理，可以将同源蛋白的功能信息转嫁到目标蛋白身上有助于我们完成对目标蛋白尤其是研究程度不足的目标蛋白的注释；2、可以帮助客户大致了解所鉴定的蛋白尤其是未表征蛋白、预测蛋白和推定蛋白等可能的名称和功能。相关服

1、首先，GO注释可以得到蛋白的功能、亚细胞定位以及可能参与的生物学过程等信息；2、可以在GO分析的结果中查询与某个感兴趣通路的相关蛋白进行后续研究；3、如果对质谱分析结果没有深入分析的头绪，可以进行GO注释，筛选关键蛋白进行后续研究。相关服务:GO功能注释及富集分析

GOslim是经过科学家人工筛选的一部分GO term，可以说是GO子集的简化版、浓缩版。GOslim去除了一些比较细枝末节的GO term，着重于研究级别更高、与物种更为相关的GO term。相关服务:GO功能注释及富集分析

蛋白质的种类众多，目前对蛋白质的功能研究尤其是一些非模式生物的蛋白质功能研究还有限，蛋白质数据库还不够完善，所以存在少数蛋白检索不到与其相似的同源蛋白。相关服务:GO功能注释及富集分析

因为同一个蛋白可能具有多种生物学功能，参与多个生物学过程，甚至存在于多个细胞之中，所以不止被统计一次，因此会存在统计饼图的蛋白总数与差异蛋白数目不一致的情况。相关服务:GO功能注释及富集分析

差异蛋白功能富集分析就是从差异蛋白的功能中富集一个功能特性，其以差异蛋白的功能条目为单位，可解释整个差异蛋白列表中蛋白的整体功能富集特征。相关服务:GO功能注释及富集分析

糖蛋白质组学的研究内容主要包括糖基化蛋白的鉴定、糖基化水平和位点的鉴定糖链的结构解析以及糖基化对蛋白的功能影响等。相关服务:糖组学分析服务

Nano LC-MS的精确性、灵敏性和准确性在一定程度上都优于MALDI-TOF MS。因为Nano LC-MS不仅能检测到肽的总量，还能检测到每个肽的两个连续片段，因此较低丰度的蛋白也能被鉴定到；其次，Nano LC-MS分析中，多肽被HPLC分离，在后续质谱分析中，一个微小的肽也能被鉴定

需要根据蛋白样本的浓度以及上样量来决定，一个蛋白带至少保证含有1pmol蛋白，如果蛋白质样本的浓度在100fmole/ul左右，每个泳道10ul上样量就能满足上样需求。相关服务:蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定

质谱法是一种分析技术，用于测量离子的质荷比。质谱图的产生以可视化该比率，这使研究人员能够鉴定和量化简单和复杂混合物中的分子。相关服务:蛋白质质谱鉴定

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