蛋白分析FAQ汇总

• • 如何解释从头测序结果？

  第一个序列（Rank 0）被认为是MS质谱的最可能解释，但排名较低的序列也可能是合理的解释。进行从头序列分析后，客户必须进行BLAST（http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi）搜索，以寻找与生物相关蛋白的同源性。BLAST搜索的目的是从数据库中寻找同源

• • 从头测序需要多少样品？

  通常需要10ng-100ng纯蛋白。对于冻干或粉末样品，需要50µg样品。相关服务:从头测序

• • 从头测序可以分析低分子质量的蛋白质吗？

  对于低分子质量（<20kD）的蛋白质，可能难以进行从头测序。在这种情况下，提供大量样品将将有益于测序工作。相关服务:从头测序

• • 什么是“鸟枪蛋白质组学”或“MuDPIT”和蛋白质组图？

  它们是使用1D或2D LC-MALDI和/或LC-MS/MS同时识别系统中所有蛋白质的相同技术的替代名称。相关服务:Shotgun鸟枪法蛋白质鉴定

• • 蛋白质组图相比2D凝胶的优势？

  在LC-MALDI和LC-MS/MS中，所有蛋白质都在一个实验中进行分析和鉴定；而在2D凝胶中，每个点都必须单独切割和鉴定。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 蛋白质组图分析一次可以鉴定出多少种蛋白质？

  1D LC-MALDI足以鉴定1000+个蛋白质；2D LC-MALDI足以鉴定2000+个蛋白质。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • iTRAQ相比2D凝胶电泳的优势？

  在使用iTRAQ的2D LC质谱中，所有蛋白质都在一次实验中进行分析、鉴定和定量；而使用2D凝胶电泳时，必须对每个斑点进行成像，测量其强度，然后切下斑点并单独鉴定。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT，SILAC

• • MS 分析所需的最少蛋白质量是多少？

  无标记定量蛋白质组学：15 µg；无标记深度分离蛋白质组学：150 µg；TMT 定量蛋白质组学：15 µg；磷酸化蛋白质组学（以及其他 PTMs）：500 µg – 1 mg；微流无标记蛋白质组学：100 µg；微流深度分离蛋白质组学：500 µg – 1 mg。0.5 – 5 µg/µl

• • 可以寄哪些类型的蛋白质组样本？

  我们能够分析各种生物体和来源的各种含蛋白质的样品：1.来自人类、细菌、真菌、动物或植物的细胞团块和组织。我们通常要求向我们提供速冻细胞团块（请提供估计的细胞数量或组织重量，并在分析前将样品储存在 -80°C）。请注意，如果您使用的需要 S2 安全级别的细胞或组织，请在将样品邮给我们之前灭活。

• • 应该在什么缓冲液中提交样本？

  如果您向我们提供蛋白质水平的样品，我们将进行蛋白质消化和肽净化。理想情况下，蛋白质应在相当“中性”pH 的水性缓冲系统中提交。蛋白质组学中常用的缓冲液是：Tris，pH 范围 7.0 - 9.0；HEPES，pH 范围 7.2 - 8.2；碳酸氢铵 NH4HCO3，pH 范围 7.0 –