蛋白分析FAQ汇总

• • iTRAQ是否可以进行生物/技术重复分析？

  可以，iTRAQ实验旨在解决生物/技术重复难题。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT，SILAC

• • iTRAQ实验是否可以确定差异表达蛋白上调还是下调？

  iTRAQ结果强调了差异表达蛋白的比率和p值，如红色（上调）或蓝色（下调）的颜色强度不同表示上下调节强度不同。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT，SILAC

• • 使用iTRAQ实验可以进行哪些比较？

  可以根据iTRAQ结果进行实验内部和内部（不同实验间）实验比较。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT，SILAC

• • 对照样品中不存在但试验中存在的蛋白质样品或对照存在但试验中不存在的蛋白质，iTRAQ会检测到吗？

  可以，当对照样品中不存在蛋白质时，iTRAQ实验以大比例识别此类蛋白质，当测试样品中不含蛋白质时，其比例为0。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT，SILAC

• • iTRAQ结果中的一种蛋白质具有95%置信度以上的肽，但没有定量值，这意味着什么？

  这通常意味着，尽管鉴定数据的质量很高（>95%置信度鉴定的肽），但该特定蛋白质的定量数据质量很差，因此ProteinPilot软件未报告定量结果（比值和p值）。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT，SILAC

• • 什么是MRM？

  MRM多反应监测（也称为选择性反应监测–SRM），是一种高度特异和灵敏的质谱技术，可选择性地定量复杂混合物中的化合物。该技术使用三重四极MS，首先靶向对应于感兴趣化合物的离子，随后该靶离子碎裂以产生一系列子离子。可以选择这些片段子离子中的一个（或多个）用于定量目的。只有满足这两个标准的化合物

• • MRM可以分析什么样的样品？

  基本上，任何可以电离然后破碎的化合物都可以用于MRM分析。最典型的例子是蛋白质和肽、代谢物或复杂混合物中的药物，如血浆和血清等。相关服务:MRM/PRM定量蛋白组学分析

• • MRM灵敏度如何？

  MRM是一种高度灵敏的质谱技术。可以检测典型MS方法通常看不到的肽化合物。例如，肽可以在毫摩尔浓度下精确定量。在复杂样品中，可以以µg/ml浓度定量肽。相关服务:MRM/PRM定量蛋白组学分析

• • MRM与绝对或相对定量兼容吗？

  MRM技术可提供任何类型定量的结果。相对定量通常是直接的，但对于绝对定量，需要适当的标准。对于绝对定量，根据加标的内标（例如，合成稳定同位素标记的肽标准）对特定肽进行定量，以产生蛋白质浓度的测量值。相关服务:MRM/PRM定量蛋白组学分析

• • 质谱可以分析的最大分子尺寸是多少？

  160,000 amu。相关服务:蛋白质质谱鉴定