蛋白分析FAQ汇总

• • 什么是序列覆盖？

  序列覆盖表示通过质谱观察到的肽段中发现的蛋白质序列中氨基酸的数量。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 你们能鉴定蛋白质修饰并进行更详细的蛋白质表征吗？

  我们提供多种翻译后修饰服务，包括二硫键分析和糖基化分析。除此之外，我们还提供物理化学和结构特性的测定。相关服务:翻译后修饰蛋白组分析

• • 你们能从蛋白质印迹中鉴定蛋白质吗？

  我们可以通过胰蛋白酶消化，然后进行 nanoLC-MS/MS 肽分析和数据库搜索，在从 1D SDS PAGE 中切除的凝胶带中鉴定出几种蛋白质。相关服务:蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定

• • 你们能鉴定一个凝胶条带中的多种蛋白质吗？

  我们可以通过胰蛋白酶消化和随后的nano LC-MS/MS 肽分析鉴定凝胶条带中的多种蛋白质。我们在UniProt数据库中搜索所有已知的蛋白质。相关服务:蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定

• • 我没有得到阳性蛋白质鉴定。什么地方出了错？

  这个问题可能是由几个问题引起的。也许您样品中的蛋白质不存在于 UniProt 数据库中，例如，如果蛋白质是全新的并且生物体基因组未测序。相关服务:蛋白鉴定

• • 什么是分子量测定？

  分子量或分子质量是一个分子基于其各个原子的原子质量的总质量。通过提供具有低测量误差（百万分之几，ppm）的质量测定，质谱可以精确测定分子组成。相关服务:分子量测定

• • 如何使用质谱服务进行肽图谱分析？

  肽图谱通过确定蛋白质氨基酸序列，利用内切蛋白酶（酶）产生肽，然后通过 HPLC 与质谱联用进行分析，被用于确认蛋白质一级结构。重要的是，肽图谱还可以定位翻译后修饰 (PTMs) ，包括： N-和O-糖基化 ；N端焦谷氨酸 ；乙酰化/甲酰化；C端赖氨酸剪裁；蛋白质稳定性指示修饰，包括脱酰胺和氧

• • 如何使用质谱服务执行蛋白质组学服务？

  蛋白质组学或蛋白质鉴定使用与液相色谱耦合的高分辨率质谱仪（例如，Orbitrap Fusion）对来自生物样品蛋白水解产生的肽进行串联质谱（MS/MS）分析。通过蛋白质数据库搜索，从与每种蛋白质相对应的几种或多种独特肽中鉴定出蛋白质。相关服务:组学分析

• • 样品在提交时应该放在什么缓冲液中？

  我们更喜欢提交考马斯染色 SDS-PAGE 凝胶的样品。凝胶应在水中彻底脱色，并放入干净且不含角蛋白的容器中。或者，样品也可以在 Laemmli 缓冲液中提交，并将在我们提供的预制凝胶上运行。用于一维电泳的样品体积不应超过 50 µl，二维电泳最大为125µl(总蛋白不超过50 ug)。相关

• • 样品中的洗涤剂是问题吗？怎样才能去除它们？

  实验室中使用的大多数标准洗涤剂（例如：SDS、Tween、Triton 等）与下游 LC/MS 分析不兼容，因此它们不应包含在您的样品中。因此，如果在样品制备过程中不能省略它们，则必须将其去除。为此，我们建议使用“Wessel-Fluegge 方案”沉淀您的蛋白质。该方案得到的干燥蛋白质颗粒