蛋白分析FAQ汇总

• • 该如何判断质谱效果的好坏?

  做PMF一般得分超过60分(P<0.05)就算成功鉴定；而串联质谱，得分超过60分或者虽然没有超过60分，但是有最少一条肽段的得分超过30分就算成功鉴定。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 一些特殊的质谱方法有什么用途？

  质谱的其它用途包括磷酸化位点分析、蛋白测序、混合蛋白鉴定(shotgun技术)以及分子量精确测定、二硫键位置分析等等。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 串联质谱鉴定和质谱测序有什么区别?

  质谱鉴定往往采用软件对已有数据库进行自动检索匹配得到结果，而质谱测序则需要根据质谱峰图中相邻或者相近峰的分子量差异直接推算出肽段的序列。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 为什么2DE的蛋白胶点有横的和竖的脱尾？

  横的脱尾可能是因为一向等电聚焦不完全、某些蛋白质本身的原因或者蛋白的丰度太高；竖的脱尾是因为二向电泳时蛋白的溶解度不好。相关服务:二维凝胶电泳服务

• • 哪些成分会影响2DE的效果？

  核酸、盐以及去垢剂等都会影响2DE电泳效果。相关服务:二维凝胶电泳服务

• • 2DE电泳的上样量应该在什么范围？

  上样量和样品有关。样品内蛋白种类多的上样量要大些，这样每个点才有足够的量被检测到。一般的全细胞裂解体系，上样量大概在100ug（银染）到 500ug（考染）之间。相关服务:二维凝胶电泳服务

• • 质谱分析前用胰蛋白酶酶解蛋白质时，碳酸氢氨的浓度应该是多少？

  酶解时碳酸氢氨的浓度一般在10-50 mM之间。浓度过大时，后续的冻干过程中会有较多的盐析出；盐浓度过小时，则不能有效的提供碱性pH的水解环境。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 单一同位素肽段质量和平均同位素肽段质量有什么区别？

  不含任何同位素的肽段的质量叫单一同位素肽段质量；同一种肽段所有的同位素形式（包括含同位素的，也包括不含同位素的）的质量的平均数叫平均同位素肽段质量。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 同位素峰之间都相差1Da吗？

  不一定，同位素肽段的质量一般是相差1Da ，但因为质谱检测到的峰是肽段的质荷比（m/z）而不是质量本身，所以在肽段带有多个电荷的情况下，同位素峰之间相差的质量也不同。如果检测到的肽段带一个电荷，那同位素峰之间是相差 1 ；如果检测到的肽段带两个电荷，那同位素峰之间便相差 0.5 ；如果检测到

• • 哪种离子化方式产生的肽段易带多个电荷？

  在蛋白质组学所涉及的质谱技术中，常见的离子化方式有 MALDI 和 ESI。经验表明， MALDI所产生的离子化肽段只带一个电荷；而ESI所产生的离子化肽段往往带有多个电荷。相关服务:蛋白质质谱鉴定