代谢组学FAQ汇总

• • 多元统计分析方法有哪些？

  多元统计分析分为无监督分析方法和有监督分析方法两种。无监督分析有主成分分析（PCA），有监督分析方法主要是偏最小二乘判别分析（PLS-DA）和正交偏最小二乘判别分析（OPLS-DA）。相关服务:代谢组学生物信息学分析

• • LC-MS与GC-MS的离子源是一样的吗？

  不一样，LC-MS使用ESI、APCI电离方式；GC-MS采用EI、CI、NCI等电离方式。相关服务:代谢组学

• • 代谢组学数据为什么要进行预处理？

  预处理就是对原始数据进行一系列降噪和基线校正等处理，以减少数据集的噪声干扰，强调其生物学信息，使其适用后续的统计分析。相关服务:代谢组学

• • 什么是数据归一化处理？

  对代谢数据集进行一系列的处理将其拉到一个特定范围里，转换为可用于进一步统计分析的可用形式。相关服务:数据归一化分析

• • KEGG通路分析中气泡图的富集因子是什么意思？

  富集因子（Rich factor）在生信分析文件夹中kegg表格中用count/pop hit表示，寓意为参与某 KEGG 通路的差异代谢产物的数目占该通路注释到的代谢产物的比例。相关服务:KEGG差异代谢产物通路分析

• • 靶向代谢组学是如何进行定性定量的？

  靶向代谢组学定性是通过质谱MRM模检测代谢物的母离子和子离子分子量实现的。靶向绝对定量是根据代谢物的实际检测峰面积与标准品的峰面积进行换算得到的。相关服务:靶向代谢组学

• • GC-MS的仪器平台有哪些？

  与气相色谱GC串联的平台主要有TOF、Q-TOF、TQ、Orbitrap、TSQ Quantum、Q Exactive™等。相关服务:代谢组学

• • GC-MS分析为什么要进行衍生化？

  因为GC是气相色谱，流动相为气体，这就要求被分析物必须能够气化，而很多内源性代谢物都含有极性基团，沸点高、不易气化。衍生化能够降低这些代谢物的沸点，使其容易气化，以便分析能够顺利进行。相关服务:代谢组学

• • 常用的GC-MS数据处理软件有哪些？

  ChromaTOF、AnalyzerPro、XCMS、MZmine 2和MS-Dial等都可以用于分析GC-MS的下机数据，但是需要将原始数据转换为软件要求的格式。相关服务:代谢组学

• • 非靶向代谢组学能检测出多少物质？

  不同检测平台的灵敏度和偏向性不同，一般来说GC-MS检测血清样品得到的峰大约在1000以上，最终能准确定性的物质约200个左右；LC-MS检测物质的数量要多很多，单次检测能得到上万个feature，最后可以准确定性的物质大概在1000个左右。相关服务:非靶向代谢组分析