代谢组学FAQ汇总

• • 什么是韦恩图（Venn）？

  韦恩图也叫文氏图，用于显示不同集合之间的所有可能的逻辑关系。相关服务:代谢组学生物信息学分析

• • 主成分分析PCA的原理是什么？

  主成分分析就是对样本的各项指标（也称维度）进行降维分析，筛选出贡献值最大的主成分，从而到达建立合适的模型来解释和预测的目的。相关服务:主成分分析（ PCA）

• • 火山图可以用来做什么？

  火山图（Volcano Plot）可以快速地查看样品物质在两个（组）样品中表达水平的差异，以及差异的统计学显著性。相关服务:单变量统计分析

• • R2和Q2分别代表什么意思？

  R2有两种，即R2X（针对PCA）和R2Y（针对PLS-DA），他们表示当前模型可对数据方差或变异进行解释的比例，即解释率。Q2表示当前模型可对数据方差进行预测的比例，即预测率。相关服务:PLS-DA/OPLS-DA二维图

• • 置换检验判断标准是什么？

  置换检验（Permutationtest）又称随机化检验或重随机化检验，通常使用的检验标准是R2<0.3，Q2<0.05。相关服务:单变量统计分析

• • 质谱或色谱的峰面积单位是什么？

  峰面积没有单位。相关服务:代谢组学

• • 总离子流图的横纵坐标分别表示什么，单位是什么？

  横轴表示时间，单位用min表示；纵轴并表示信号强度，没有单位。相关服务:代谢组学

• • “面积归一化”中的“面积”是指一个样本的总面积还是所有样本的总面积？

  一个样本检测的所有物质的总面积。相关服务:数据归一化分析

• • 如何从TIC图中找到目标物质的那个信号峰？

  结合保留时间（RT）和特征质荷比（M/Z）值寻找。相关服务:代谢组学

• • 在寻找差异物的过程中为什么对比分析只能两两对比？

  因为只能比较一种物质在一组种的含量相对于另一组是上升还是下降，无法同时计算相对于两组变化的量。相关服务:KEGG差异代谢产物通路分析