代谢组学FAQ汇总
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对代谢数据集进行一系列的处理将其拉到一个特定范围里,转换为可用于进一步统计分析的可用形式。相关服务:数据归一化分析
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富集因子(Rich factor)在生信分析文件夹中kegg表格中用count/pop hit表示,寓意为参与某 KEGG 通路的差异代谢产物的数目占该通路注释到的代谢产物的比例。相关服务:KEGG差异代谢产物通路分析
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靶向代谢组学定性是通过质谱MRM模检测代谢物的母离子和子离子分子量实现的。靶向绝对定量是根据代谢物的实际检测峰面积与标准品的峰面积进行换算得到的。相关服务:靶向代谢组学
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与气相色谱GC串联的平台主要有TOF、Q-TOF、TQ、Orbitrap、TSQ Quantum、Q Exactive™等。相关服务:代谢组学
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因为GC是气相色谱,流动相为气体,这就要求被分析物必须能够气化,而很多内源性代谢物都含有极性基团,沸点高、不易气化。衍生化能够降低这些代谢物的沸点,使其容易气化,以便分析能够顺利进行。相关服务:代谢组学
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ChromaTOF、AnalyzerPro、XCMS、MZmine 2和MS-Dial等都可以用于分析GC-MS的下机数据,但是需要将原始数据转换为软件要求的格式。相关服务:代谢组学
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不同检测平台的灵敏度和偏向性不同,一般来说GC-MS检测血清样品得到的峰大约在1000以上,最终能准确定性的物质约200个左右;LC-MS检测物质的数量要多很多,单次检测能得到上万个feature,最后可以准确定性的物质大概在1000个左右。相关服务:非靶向代谢组分析
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代谢组学的研究步骤一般包括样本采集、上机分析、数据处理、差异代谢物筛选与结构鉴定、通路分析和诊断预测分析等。相关服务:代谢组学
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可在整个实验环节加入QC体系样本、多内标校准、保留指数校准以及跨时间质量控制体系来确保实验误差处于低水平。相关服务:代谢组学
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理论上同一台仪器和相同的检测方法对于同一种物质的响应是一样的。相关服务:代谢组学
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