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• 多肽质谱分析:MS1 / MS² 信息量、仪系选择与和色谱联用的取舍
说明多肽质谱链路中串联层级信息量差异及与液相色谱组合的一般化取舍思路。
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• 体外蛋白质交联表征指南:交联化学与LC‑MS互作图谱解读
体外交联(XL)与 nano LC‑MS/MS:交联剂选择、拓扑约束读出、IP/Pull‑down 协同与FAQ。
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• 蛋白质体外交联是什么:怎么用交联试剂 + LC‑MS/MS 读弱相互作用
介绍体外交联锁定弱相互作用并以质谱读交联位点的概念、流程与研究边界。
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二级质谱(MS/MS)多肽鉴定通过母离子选择与碎片离子谱获得 b/y 等离子信息,再结合数据库检索或 de novo 完成多肽定性、定量与修饰分析。说明 LC-MS/MS 工作流程、二级谱图含义及与肽质量指纹等策略的差别。
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比较蛋白质组学研究技术、定量蛋白组学和普通蛋白定量的关系,说明样品制备、分离、质谱鉴定、Label Free、TMT/iTRAQ、SILAC、DIA 和靶向验证的适用场景。
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• PRM 和 DDA 有什么区别?蛋白质组学采集模式与应用选择
比较 PRM(平行反应监测)和 DDA(数据依赖采集)的原理、优缺点、适用场景和实验设计,说明何时做发现型鉴定,何时做靶向验证。
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• iTRAQ 是相对定量还是绝对定量?原理、流程与适用场景
回答 iTRAQ 是相对定量还是绝对定量,并说明同重标签、reporter ion、4-plex/8-plex、内标肽绝对定量、TMT/SILAC/Label-free 对比和实验设计要点。
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说明蛋白质分离与鉴定技术如何通过电泳、二维电泳、HPLC、层析等方法降低样品复杂度,再用 MALDI-TOF、LC-MS/MS 和数据库检索确认蛋白身份。
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说明肽质量指纹(PMF)如何通过实验肽质量集合与数据库理论肽质量比对推断蛋白身份,并比较 PMF、MALDI-TOF 和 LC-MS/MS 的适用场景。
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说明磷酸化定量蛋白组学如何通过 TiO2、IMAC 或抗体富集磷酸化肽段,并结合 LC-MS/MS、Label-free、TMT、DIA 或 PRM 分析位点丰度变化。
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