2D Blue Native/SDS-PAGE复合物分析中，marker用什么呢？

在2D Blue Native/SDS-PAGE复合物分析中，首先通过Blue Native PAGE (BN-PAGE) 分离蛋白质复合物，然后在第二维使用SDS-PAGE分离复合物中的单个蛋白质。因此，可能需要两种类型的标记物：一种用于BN-PAGE，另一种用于SDS-PAGE。




1. BN-PAGE标记物

对于BN-PAGE，标记物应该是已知大小的蛋白质复合物，因为第一维的分离基于复合物的大小和形状。例如：

• 高分子量蛋白质Maker：可以使用商业化高分子量蛋白质Maker，如NativeMark™ Unstained Protein Standard（Thermo Fisher Scientific）等。这些Maker包含几个不同大小的蛋白质复合物，可用于估计未知样品中复合物的分子量。



2. SDS-PAGE标记物

对于第二维的SDS-PAGE，标记物应该是已知大小的单个蛋白质，因为SDS-PAGE基于蛋白质的分子量进行分离。例如：

• 预染蛋白质分子量标记物：如PageRuler™ Plus Prestained Protein Ladder（Thermo Fisher Scientific），包含一系列预染色的标准蛋白质，分子量覆盖范围广，可以直观地观察到电泳过程和转移效果。



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