您好，想问一下，切胶回收蛋白，可以只做质谱分子量吗？这样我是不是要跑非变性的胶？尽量保证蛋白的完整性？

切胶回收的蛋白样品当然可以用来做质谱分析以测定分子量，这是质谱在蛋白质组学中的一个常见应用。

质谱分析通常需要将蛋白质进行酶切，生成肽段，然后通过质谱仪进行检测。在这个过程中，蛋白质的三维结构会被破坏。因此，对于质谱分析来说，使用非变性胶或变性胶并没有本质区别。然而，在某些情况下，使用非变性胶可能有助于保留蛋白质的生物活性，从而有利于后续的实验研究。因此，选择是否使用非变性胶取决于实验目的和需求。

在进行质谱分析时，确保蛋白质的完整性是非常重要的。蛋白质的完整性会影响质谱分析的准确性和可靠性。如果蛋白质在实验过程中被降解或者破坏，可能导致质谱分析结果的偏差。因此，在进行质谱分析之前，需要采取一定的措施来保护蛋白质免受降解和破坏。这些措施包括使用蛋白质酶抑制剂、避免多次冻融、使用适当的缓冲液等。