蛋白分析FAQ汇总
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蛋白质串联质谱(Tandem Mass Spectrometry, 简称MS/MS)是蛋白质组学研究领域的一个核心技术。它的基本原理是将目标蛋白质或多肽进行酶解,生成肽段,然后通过质谱分析仪测定这些肽段的质荷比(m/z)及其相对丰度。它被广泛应用于蛋白质鉴定、蛋白质定量、翻译后修饰分析等研
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• 有没有人做蛋白质二级结构预测相关的内容。还有就是有没有做过的大佬给一点建议,谢谢了?
蛋白质二级结构指的是肽链局部的空间结构,是由主链折叠产生的以氢键维系的有规则的、不对称的构象,如α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲等,这些不对称结构使蛋白质分子具有圆二色性。圆二色谱(Circular Dichroism,CD),又称圆二色光谱,根据待测物的圆二色性分析
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• 如何研究一种没有同源蛋白的新蛋白呢?不知具体功能,没法生信预测的话,可以从哪些方面入手呢?
研究一种没有同源蛋白的新蛋白在科学研究中相当具有挑战性。当缺乏具体功能信息和生物信息学预测时,可以从以下几个方面入手: 1.序列分析:尽管没有找到同源蛋白,但对新蛋白的序列进行详细分析仍然有意义。寻找保守的结构域、功能基序或具有生物学意义的短肽序列,这可能有助于揭示蛋白的功能或结构特征
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• 中药中单一活性成分的蛋白质组学研究是否有意义?以及可以采取哪些方法进行实验设计?
中药中单一活性成分的蛋白质组学研究可以揭示该活性成分对生物体内蛋白质组的影响,从而帮助我们理解其作用机制和潜在药理效果。实验设计方面,可以采取以下方法: 1.活性成分提取与纯化:首先需要从中药中提取并纯化目标活性成分。常见的提取方法包括水提、醇提、超临界流体提取等。纯化
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要检测蛋白质是否被蛋白酶完全水解,可以使用以下方法: 1.SDS-PAGE:在蛋白酶水解过程中,周期性地取样并通过SDS-PAGE(Sodium Dodecyl Sulfate - Polyacrylamide Gel Electrophoresis)检测。通过比较蛋白
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• 圆二色谱分析蛋白二级结构,怎么准备样品,样品浓度,样品buffer?
圆二色谱(Circular Dichroism,CD)是一种常用于分析蛋白质二级结构的光谱技术。样品的准备和测量条件对CD谱的质量和准确性有很大影响。在制备样本过程中,需要注意: 1.样品准备: 蛋白质需要纯化,尽量避免杂质和其他干扰物质。 如果蛋白质需要进行重折叠,应确保获
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使用MaxQuant解析蛋白质质谱的基本步骤如下: 1.数据预处理:收集原始的蛋白质质谱数据,如.raw格式文件,这通常来自质谱设备。您也需要关于您的样品的一些基本信息,如蛋白酶的类型(例如,胰蛋白酶)以及修饰。 2.设置参数:在MaxQuant中设置您的质谱实验的特定参数。
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要了解肿瘤细胞中存在的蛋白质,可以通过以下几种方法来实现: 1.蛋白质组学:蛋白质组学是研究蛋白质组(proteome)的科学,即在特定生物系统中存在的所有蛋白质。要了解肿瘤细胞中的蛋白质组成,首选的方法就是进行蛋白质组学分析: 1)样本准备:首先,从肿瘤细胞中提取
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圆二色谱(Circular Dichroism,CD)是一种用于研究蛋白质二级结构的技术。通过分析CD光谱,可以了解蛋白质中α-螺旋、β-折叠和无规卷曲等二级结构的比例。要使用CD验证蛋白二级结构比例与已知蛋白结构一致,可以按照以下步骤操作: 1.准备蛋白样品:首先需要
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检测细胞和组织内特异性蛋白的方法有很多,以下是一些常见的方法及其原理: 1.免疫印迹(Western Blot): 原理:利用特异性抗体识别目标蛋白。首先对细胞或组织样本进行蛋白质提取,然后通过SDS-PAGE(Sodium Dodecyl Sulfate - P
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