蛋白分析FAQ汇总

考马斯亮蓝、铜染、锌染和银染都可以，但是要注意传统的银染方法含有感光剂与质谱不相容，因此若要使用银染染色，推荐使用ProteoSilver Plus, Sigma (Product # PROTSIL1 or PROTSIL2)或Dodeca Silver Stain, BioRad (Pr

1、一定要避免污染，切胶时戴上干净的手套，避免任何可能被污染的物体直接接触到表面，使用干净的刀片和容器；2、切的条带不宜过大和过小，尽可能在条带边缘进行切割，太小的条带意味着样本的损失，过大的条带可能会引入污染蛋白；3、切取的蛋白条带及时转移到干净的EP管中，密封保存，防止凝胶变干。相关服务

标记定量适合分析背景较相似的样本间的蛋白组差异，且定量数据较准确，若样本数量小于等于8可以选择iTRAQ，若样本数量在8-16之间，可以选择TMT。非标定量对样本数和样本背景是否相似没有特别的限制，相比标记定量，价格也更便宜。相关服务:定量蛋白组分析

传统的Lable free耗时久、重复性差、数据结果可信度不高；DIA定量是新一代非标记定量技术，采用数据非依赖模式进行数据采集，在相同时间采集到更丰富的信息，压缩周期的同时大福度提高样本间平行比较的重复性，数据结果可信度极高。相关服务:DIA定量蛋白质组学

至少要进行两次重复，否则数据说服力不强，发文章时可能会被质疑。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT， SILAC

从结果的科学性上来说，建议一种实验所得到的结果再用其他方法进行验证一下，推荐使用WB/MRM/PRM技术进行验证。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT， SILAC

有目标蛋白的序列信息，可以用MRM替代WB技术进行目标蛋白的精确定性定量分析。相关服务:MRM/PRM定量蛋白组学分析

一般情况下，MRM可同时检测200对transition，大概20-40个蛋白，但实际还要看蛋白样品的丰度以及复杂程度等。相关服务:MRM/PRM定量蛋白组学分析

进行MRM必须明确知道目标蛋白质，并获得蛋白质的全序列。相关服务:MRM/PRM定量蛋白组学分析

有基因组信息一般都会有预测的蛋白序列库，也可以根据基因组信息先翻译成氨基酸序列再进行MRM。相关服务:MRM/PRM定量蛋白组学分析

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