蛋白分析FAQ汇总

• • 翻译后修饰——糖基化位点会抑制样品蛋白的鉴定吗？

  如果蛋白质的纯度和浓度很高，那么在大多数情况下，基于质谱的蛋白质鉴定仍然是有利的。 然而，连接的碳水化合物（CHO）链会通过以下机制削弱基于质谱的特定肽段的鉴定：a) CHO 链可以阻断胰蛋白酶切割；b) 连接的 CHO 链的可变质量会降低糖肽检测；c) 可选项：在凝胶上样和质谱分析之前，用

• • 翻译后修饰——想对蛋白质中潜在的磷酸化位点进行初步分析。最低成本的服务是什么？有什么限制？有什么建议？

  最低成本的初步分析是一种使用 MALDI-TOF/TOF 对凝胶中的纯蛋白质或高纯度样品进行分析的方法。限制：如果蛋白质非常大、不纯或产量低（小于500 ng），蛋白质的覆盖率会很低。建议：对于初步的低成本分析，只提供高质量的样品（凝胶上的单个条带，在 1 μg 范围内）。相关服务:磷酸化定

• • 如何选择离子源？

  根据样本的性质选择离子源，小分子量的极性较小的化合物可以考虑APCI，分子量较大并带有一定极性的化合物可以选择ESI。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 气质和液质有什么区别？

  气质即气相色谱-质谱联用（GC-MS),液质即气相色谱-质谱联用(LC-MS),二者在分离手段、真空系统和电离方式方面都不同：气质采用气相色谱分离，液质液相色谱分离；气质的真空系统比较简单，而液质的相对复杂；气质的电离方式主要有电子电离和化学电离，液质的电离方式主要有电喷雾电离、大气压化学电

• • 电喷雾电离(ESI)和大气压化学电离(APCI)有什么区别？

  1、电离方式不同：APCI利用电晕放电气相离子化；ESI利用离子蒸发液相离子化。2、适合分析的化合物不同：APCI适合弱极性，小分子化合物，且具有一定的挥发性；ESI 极性化合物和生物大分子。3、二者流速不同：ESI一般流速较小，APCI 相对较大。4、产生的电荷数不同：APCI不能生成一系

• • 什么是CID和CAD？

  CID-碰撞诱导解离，是一级质谱解离方式，通常在真空接口处调节电压发生CID现象。CAD-碰撞活化解离是二级质谱解离方法，选定的母离子被碰撞活化产生子离子的过程。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 串联质谱MS/MS是如何定量的？

  串联质谱是以母离子二级质谱产生的碎片峰（子离子）进行定量的。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 蛋白质鉴定服务——质谱法鉴定蛋白质的工作原理是什么？

  用胰蛋白酶将蛋白质消化成肽段，然后将每个肽段电离并在质谱仪中单独分析。该过程通过断开氨基酸将每个肽段进行片段化，并使用 Mascot 搜索算法将得到的片段光谱与数据库进行比较，以寻找相同的氨基酸序列。这个过程可以鉴定已知的蛋白质，或密切相关的蛋白质。 注意：对于无法通过自动数据库分析鉴定的样

• • PCT提取蛋白对温度有什么特殊要求吗？

  PCT提取蛋白对温度没有特殊要求，辅助样本裂解和酶解基本是在室温或者30℃的温度下进行的。相关服务:PCT-DIA蛋白质组学

• • PCT-DIA技术只能分析石蜡切片组织吗？

  不是的，细胞样本、石蜡组织穿刺样本、新鲜组织/临床活体穿刺组织、石蜡组织切片/甲醛固定组织切片等样品都可以做PCT-DIA分析。相关服务:PCT-DIA蛋白质组学