蛋白分析FAQ汇总

• • 银染或荧光染色的胶点胶条样品是否需要合并？

  最好合并，提供尽可能多的蛋白质增加了成功鉴定的机会。银染样品至少合并2个胶点，sypro ruby或Cy dyes至少合并3个胶点。相关服务:蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定

• • 样品污染会影响质谱鉴定吗？

  毫无疑问，在分析前若样品存在污染会先进行去污处理。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 怎么判断染色方法与质谱是否兼容？

  对于考马斯染色，没有额外要求。对于银染，必须使用与质谱兼容的程序。可以使用与质谱兼容的银染色试剂盒（如Amersham International:Plus One染色试剂盒）。Sypro ruby与质谱分析兼容，但需要合并谱带。相关服务:蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定

• • 放置较久的胶点胶条样品可以进行质谱分析吗？

  要看情况，一般考马斯染色的斑点和条带即使放置几个月也可以分析。银染斑点和条带可在数周前进行分析，但超过1-2个月的银染凝胶可能不会产生令人满意的结果。相关服务:蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定

• • 胶点胶条样品可以以液体形式进行分析吗？

  可以，前提是样品是纯的，并且在低盐缓冲液中，例如50mM碳酸氢铵；对于TRIS或磷酸盐缓冲液，最大盐强度为20mM。NaCl和表面活性剂（例如SDS）不能存在。装运前，样品必须在微型离心管中冷冻干燥或冻干。相关服务:蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定

• • 胶点胶条样品在PVDFM膜上，可以进行质谱分析吗？

  不可以，样品必须是凝胶带或冻干。相关服务:蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定

• • 质谱可以分析免疫沉淀（下拉）的蛋白样品吗？

  免疫沉淀制备溶液不能直接分析，因为抗体的存在淹没了来自目标蛋白的信号，因此需要先进行1D SDS-PAGE凝胶分离。相关服务:蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定

• • 质谱是否可以使用其他酶（除了胰蛋白酶）来消化蛋白质？

  所有标准分析都使用胰蛋白酶消化，因为它是蛋白质组学中最有效的酶。但是如果有需要，可以使用其他酶，如糜蛋白酶和谷氨酸酶等。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 蛋白质样品可以在酶消化后送样吗？

  不可以。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 质谱分析前蛋白质是否被还原和烷基化？

  蛋白质质谱鉴定不需要进行半胱氨酸的还原和烷基化。相关服务:蛋白质质谱鉴定