蛋白分析FAQ汇总

• • 什么是“鸟枪蛋白质组学”或“MuDPIT”和蛋白质组图？

  它们是使用1D或2D LC-MALDI和/或LC-MS/MS同时识别系统中所有蛋白质的相同技术的替代名称。相关服务:Shotgun鸟枪法蛋白质鉴定

• • 蛋白质组图相比2D凝胶的优势？

  在LC-MALDI和LC-MS/MS中，所有蛋白质都在一个实验中进行分析和鉴定；而在2D凝胶中，每个点都必须单独切割和鉴定。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • 蛋白质组图分析一次可以鉴定出多少种蛋白质？

  1D LC-MALDI足以鉴定1000+个蛋白质；2D LC-MALDI足以鉴定2000+个蛋白质。相关服务:蛋白质质谱鉴定

• • iTRAQ相比2D凝胶电泳的优势？

  在使用iTRAQ的2D LC质谱中，所有蛋白质都在一次实验中进行分析、鉴定和定量；而使用2D凝胶电泳时，必须对每个斑点进行成像，测量其强度，然后切下斑点并单独鉴定。相关服务:基于标签的蛋白质定量技术-iTRAQ，TMT，SILAC

• • MS 分析所需的最少蛋白质量是多少？

  无标记定量蛋白质组学：15 µg；无标记深度分离蛋白质组学：150 µg；TMT 定量蛋白质组学：15 µg；磷酸化蛋白质组学（以及其他 PTMs）：500 µg – 1 mg；微流无标记蛋白质组学：100 µg；微流深度分离蛋白质组学：500 µg – 1 mg。0.5 – 5 µg/µl

• • 可以寄哪些类型的蛋白质组样本？

  我们能够分析各种生物体和来源的各种含蛋白质的样品：1.来自人类、细菌、真菌、动物或植物的细胞团块和组织。我们通常要求向我们提供速冻细胞团块（请提供估计的细胞数量或组织重量，并在分析前将样品储存在 -80°C）。请注意，如果您使用的需要 S2 安全级别的细胞或组织，请在将样品邮给我们之前灭活。

• • 应该在什么缓冲液中提交样本？

  如果您向我们提供蛋白质水平的样品，我们将进行蛋白质消化和肽净化。理想情况下，蛋白质应在相当“中性”pH 的水性缓冲系统中提交。蛋白质组学中常用的缓冲液是：Tris，pH 范围 7.0 - 9.0；HEPES，pH 范围 7.2 - 8.2；碳酸氢铵 NH4HCO3，pH 范围 7.0 –

• • 哪些是在蛋白质组学分析中严格避免使用的缓冲液添加剂？

  洗涤剂，如NP-40或Triton X-100通常是有问题的且应该完全避免使用的。如果可能 ，也要避免使用甘油。金属盐（Na +、K +和磷酸盐），如氯化钠会影响电喷雾电离，因此必须在所有样品的最后一个肽清洗步骤中去除。相关服务:组学分析

• • 为什么样品中有聚乙二醇 PEG 污染？

  聚乙二醇 (PEGs) 的重污染是质谱分析中的一个大问题。它们会对您的数据产生负面影响，并且非常难以摆脱。我们观察到，PEGs 的常见来源是样品制备过程中使用的过滤器和膜，例如 0.2 或 0.45 µm 过滤器或 MWCO 过滤器。根据公司的不同，这些过滤器和膜可能会被 PEG 严重污染。

• • 我在我的蛋白质列表中看到了许多角蛋白。它们来自哪里？

  角蛋白来自皮肤或头发。它们通常存在于每个样品中，并在数据分析过程中作为“潜在污染物”被过滤掉。相关服务:蛋白分析