Edman降解:蛋白质和肽段的氨基酸序列鉴定方法

    Edman降解是一种用于顺序确定多肽(如蛋白质和肽段)N-末端氨基酸序列的化学方法。该方法是由Pehr Edman在20世纪50年代开发的。

    Edman测序反应过程2

    图1.Edman测序反应过程

    一、工作原理:


    1.反应

    肽或蛋白质首先与Edman试剂(酚异硫氰酸)反应。这导致N-末端的氨基酸与该试剂形成一个稳定的环状硫化衍生物。


    2.解链

    接着,通过加热或使用酸,这个环状衍生物从肽链上断裂,从而释放出一个与N-末端氨基酸对应的硫化衍生物。


    3.分析

    然后可以通过色谱法或其他分析技术鉴定这个衍生物,从而确定原始肽段或蛋白质的N-末端氨基酸。


    4.重复

    对于多于一个氨基酸的肽或蛋白质,此过程可以连续重复,每次识别下一个氨基酸,直到整个序列被确定或降解效率下降为止。


    二、优势与局限性:


    1.优势

    (1)Edman降解是一种非常特异的方法,对N-末端氨基酸的鉴定非常准确。

    (2)与质谱相比,它不需要复杂的仪器。


    2.局限性

    (1)Edman降解的效率随序列长度的增加而减小。通常,该方法最适合鉴定较短的肽段,例如50个氨基酸以下。

    (2)对于某些难以处理的氨基酸或化学修饰,该方法可能不那么有效。

    (2)在一些应用中,质谱法可能更快且更灵敏。


    尽管近年来质谱在蛋白质序列分析中的应用逐渐增多,Edman降解仍然是一个重要的工具,特别是对于某些特定的研究问题或应用。


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