多组学分析FAQ汇总

  • • 转录组测序AT分离是什么原因呢?

    在转录组测序(如RNA-seq)中,如果观察到AT分离现象,即高比例的腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)而低比例的鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C),可能是由多种原因引起的: 1. GC含量偏低: GC含量是指DNA或RNA序列中G和C的比例。在转录组测序中,如果待测样品的GC含量较低,那么在测序过程中

  • • 转录组测序后怎么进行后续筛选?

    当进行转录组测序后,我们通常会得到大量的转录组数据。为了从这些数据中筛选出有意义的信息,我们可以采取以下步骤进行后续筛选: 1. 数据质控: 首先,我们需要对测序数据进行质控,以确保数据的准确性和可靠性。包括检查测序质量得分、去除低质量的碱基、去除接头序列和过滤掉含有未知碱基的reads等

  • • 想送肺炎支原体患儿肺泡灌洗液的转录组学,但pbs长菌了,对样本结果有影响吗?

    当我们讨论实验样本的准确性和可靠性时,任何的污染都是不可接受的。在你提到的情况下,肺泡灌洗液的样本中PBS(磷酸盐缓冲溶液)的细菌污染可能会对转录组学分析的结果产生显著影响: 1.基因表达的干扰: 细菌的RNA可能会与患儿的RNA混合,导致在后续的RNA测序中,我们无法区分哪些RNA来自患

  • • 送几株细胞去转录组测序,细胞间基因表达量相差好大,该如何处理?

    当细胞转录组测序结果显示显著的基因表达差异时,可以通过数据标准化、批次效应校正、考虑细胞周期的影响、数据筛选、深入的生物统计分析以及考虑生物学因素等方法进行处理。

  • • 你好rna病毒扩增子测序引物设计

    对于RNA病毒扩增子测序,引物设计是关键的一步。通常需要根据病毒基因组的特点和目标区域来设计引物。希望以下引物设计的一般步骤可以帮助到您:   1.选择目标区域:首先需要确定要进行扩增子测序的病毒基因组中的目标区域。选择目标区域时应考虑具有较高保守性、生物学功能重要性和/或与病原性相关的

  • • 为什么采用多组学?

    多组学具有以下优势: 它允许研究人员直接测量生物表型的原因和结果,而不是根据不完整的数据进行推断。 它帮助研究人员更好地将基因型与表型联系起来,提供仅靠单一组学方法无法获得的科学见解,并有助于推动新药物靶标的发现。 它通过允许研究人员见证生命分子之间复杂的相互作用,增加了发现能力并提供了对生

  • • 前5种多组学分析方法

    基因组学+转录组学 结合 RNA-Seq 可以帮助研究人员对变异进行注释和优先排序,以进行功能分析,了解疾病机制。功能基因组学的多组学方法可以帮助推动药物靶标识别和生物标志物发现。 基因组学+表观遗传学 全面的表观遗传分析可以揭示基因调控模式,以帮助发现 GWAS 识别的变体的功能。将甲基

  • • 什么是RNA-Seq?

    RNA-Seq是一种利用下一代测序技术进行转录组分析的方法。RNA-Seq提供了每个样品中RNA序列的全面、定量和无偏倚的视图,是目前可用于分析基因表达的最强大的工具。相关服务:多组学整合分析

  • • 转录组测序——接受哪些起始材料?

    我们建议从总RNA开始。但是,我们在从各种材料(包括细胞团块、新鲜冷冻组织、血液和FFPE载玻片)中提取RNA方面拥有丰富的经验。我们还接受用于超低输入RNA-Seq的分选细胞。相关服务:多组学整合分析

  • • 转录组测序——用什么方法去除核糖体RNA?

    由于核糖体RNA(rRNA)占总RNA的大部分,因此去除它对于其他RNA种类(如mRNA、长链非编码RNA(lncRNA)和小RNA)的高效测序是必要的。 对于标准和链特异性RNA-Seq,您可以选择poly-A选择或rRNA耗尽方法。Poly-A选择对于真核生物中mRNA的研究是足够的。分

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