多组学分析FAQ汇总

• • 多组学分析有哪些思路？

  多组学分析是一种综合利用多种高通量技术和数据分析方法来研究生物系统的方法。它可以帮助我们全面了解生物系统的复杂性和多样性，揭示基因、蛋白质、代谢物等分子之间的相互作用和调控网络。在生物药物领域，多组学分析可以用于药物研发的各个环节，包括药物靶点的发现、药物作用机制的解析、药物剂量的优化等。以

• • 多组学分析可以揭示微生物互作对微生物群落的影响吗？

  多组学分析可以揭示微生物互作对微生物群落的影响。 多组学分析可以通过整合不同层面的数据，提供全面的视角来研究微生物互作对微生物群落的影响。例如，通过基因组学分析可以了解微生物的基因组组成和功能潜力，从而推测其在微生物群落中的作用。转录组学分析可以揭示微生物在特定环境中的基因表达模式，进一步

• • 转录组和什么组学联合较好？

  选择与转录组学结合的组学类型应该基于你的研究目标、可用资源、以及你希望回答的科学问题。以下是几个常见的选择及其独特的优势： 1.转录组学与基因组学的联合： 如果你的研究涉及到个体间的基因差异，以及这些差异如何影响表型，基因组学可能是一个重要的领域。特别是在研究遗传疾病或个体对药物反应的差异

• • 请问有人知道转录组动物取样的步骤吗？跟代谢组一样吗？取好的脂肪组织需要放在PBS中洗去血丝和毛吗？

  转录组学和代谢组学的取样步骤有所不同，因为它们分别旨在分析不同类型的生物分子——转录组学分析RNA，而代谢组学分析细胞或组织中的代谢物。尽管两者都需要高质量的样本以确保准确的数据分析，但是样本的处理和保存方法因分析的目标分子而异。 转录组学和代谢组学在动物取样时的一般考虑因素和步骤如下：

• • 做完转录组测序后，只做了差异基因分析，不做KEGG与GO分析，该如何进行后续？

  当做完转录组测序后，只进行了差异基因分析而没有进行KEGG与GO分析，可以考虑以下几个后续步骤： 1.确定差异基因的生物学意义： 首先，需要对差异基因进行生物学意义的解读。通过查阅相关文献和数据库，了解这些差异基因在生物学过程中的功能和调控作用。这可以帮助我们理解差异基因的潜在生物学意义，

• • 请问宏转录组的差异表达基因分析和差异表达通路分析如何进行？

  进行宏转录组的差异表达基因分析和差异表达通路分析时，可以按照以下步骤进行： 1.数据预处理： 对原始测序数据进行质量控制，包括去除低质量的reads和去除接头序列等。 使用比对工具将清洗后的reads比对到参考基因组或转录组上，得到比对结果。 2.差异表达基因分析： 使用比对结果计

• • 常规样本与石蜡包埋样本全转录组测序，数据质量是否不同？

  常规样本（如新鲜冻存的组织或细胞）和石蜡包埋样本（如福尔马林固定石蜡包埋，FFPE）的全转录组测序确实在数据质量上可能存在差异。这些差异主要是由样本处理、保存方法以及RNA的提取和质量等因素造成的。 一、RNA的完整性： 1.常规样本： 通常来自新鲜或快速冻结的组织，其中的RNA更完整，

• • 植物进行冰冻切片后还能提取RNA，进行转录组测序吗？

  植物样本在经过冰冻切片处理后理论上仍然可以提取RNA进行转录组测序，但确实存在一些额外的挑战和限制。以下是在这种情况下需要特别注意的关键点： 1.RNA降解： 冰冻切片过程可能会对组织造成一定的应激，这可能激活某些RNases，导致RNA降解。此外，如果切片在切割后未能立即适当存储（例如，

• • 转录组测序中的reads翻译回来是啥？

  在转录组测序中，“reads”是一个非常基本的术语，指的是通过测序平台从DNA或RNA样本中获得的短序列片段。 当你对一个样本（如转录组，即所有RNA的集合）进行测序时，现代的测序技术并不是读取整个单一的长DNA或RNA分子。相反，它们通过一系列复杂的步骤破碎原始的生物分子，并从这些较小的

• • 扩增子测序中16S、18S和ITS的区别及应用范围是什么？

  16S和18S是指细菌和真核生物的小亚基核糖体RNA基因，它们在细胞中起到编码蛋白质的功能。ITS是指内转录间隔区（Internal Transcribed Spacer），是真菌和其他真核生物的核糖体RNA基因中的非编码区域。 一、16S、18S和ITS的区别是什么？ 1.16S和18