多组学分析FAQ汇总

• • 转录组测序多少测序数据量合适？

  转录组测序（RNA-seq）所需的测序数据量取决于你的实验目标和研究类型，以下数据可供您参考： 1.基因表达定量: 对于基本的基因表达水平定量，通常每个样本需要至少30-50 million paired-end reads。 2.差异表达分析: 进行差异表达分析时，通常建议至少20-3

• • 转录组测序数据解读？

  转录组测序数据可以从以下几个方面解读： 1.基因表达定量: 分析每个基因的读段计数数据，这是基因表达水平的一个量化指标。 2.差异表达分析: 识别在不同条件或样本组之间表达水平显著不同的基因。 3.转录本组装和新转录本发现: 如果进行了全转录组测序，你可以通过组装读段来识别已知和新的转

• • 怎么将转录组测序数据上传GEO？

  将转录组测序数据上传到GEO（Gene Expression Omnibus）数据库的步骤如下： 1.注册GEO账号： 在上传数据之前，你需要在GEO数据库上注册一个账号。可以通过访问GEO网站（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/）并点击“Register”

• • 三代全长转录组测序与RNA-seq有什么区别呀？

  三代全长转录组测序与RNA-seq是两种常用的转录组测序技术，它们在测序原理、应用范围和数据分析等方面存在一些区别。下面我将详细解答你的问题，并逐步解释这两种技术的区别。 1.测序原理： 三代全长转录组测序：三代测序技术主要包括PacBio SMRT（Single Molecule Re

• • 转录组测序和RNA seq的区别？

  转录组测序（transcriptome sequencing）是一种利用高通量测序技术来研究转录组的方法，也就是说，它可以用来测定一个特定生物或细胞类型的所有RNA分子。而RNA测序（RNA-seq）是转录组测序的一种，是一种利用深度测序技术特异性地研究转录组中的mRNA（信使RNA）水平的

• • 跟大家请教一个问题，我的实验材料是花，做转录组、蛋白组测序取样该分离还是整花？

  是否需要分离植物花的各个部分或使用整花进行转录组和蛋白组测序，这完全取决于研究的具体目标。 如果研究的目的是了解整个花朵的基因表达和蛋白质组成，那么可以使用整花进行取样。这样做简化了取样过程，并能提供一个全面的、整体的视角。 如果研究的目的是探索特定花朵部分（如花瓣、雄蕊、雌蕊等）中的基

• • 多组学分析有哪些思路？

  多组学分析是一种综合利用多种高通量技术和数据分析方法来研究生物系统的方法。它可以帮助我们全面了解生物系统的复杂性和多样性，揭示基因、蛋白质、代谢物等分子之间的相互作用和调控网络。在生物药物领域，多组学分析可以用于药物研发的各个环节，包括药物靶点的发现、药物作用机制的解析、药物剂量的优化等。以

• • 多组学分析可以揭示微生物互作对微生物群落的影响吗？

  多组学分析可以揭示微生物互作对微生物群落的影响。 多组学分析可以通过整合不同层面的数据，提供全面的视角来研究微生物互作对微生物群落的影响。例如，通过基因组学分析可以了解微生物的基因组组成和功能潜力，从而推测其在微生物群落中的作用。转录组学分析可以揭示微生物在特定环境中的基因表达模式，进一步

• • 转录组和什么组学联合较好？

  选择与转录组学结合的组学类型应该基于你的研究目标、可用资源、以及你希望回答的科学问题。以下是几个常见的选择及其独特的优势： 1.转录组学与基因组学的联合： 如果你的研究涉及到个体间的基因差异，以及这些差异如何影响表型，基因组学可能是一个重要的领域。特别是在研究遗传疾病或个体对药物反应的差异

• • 请问有人知道转录组动物取样的步骤吗？跟代谢组一样吗？取好的脂肪组织需要放在PBS中洗去血丝和毛吗？

  转录组学和代谢组学的取样步骤有所不同，因为它们分别旨在分析不同类型的生物分子——转录组学分析RNA，而代谢组学分析细胞或组织中的代谢物。尽管两者都需要高质量的样本以确保准确的数据分析，但是样本的处理和保存方法因分析的目标分子而异。 转录组学和代谢组学在动物取样时的一般考虑因素和步骤如下：