多组学分析FAQ汇总
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• 转录组测序，同一个测序文件，高度相似的两个基因的fragment计数是不是应该差不多？已解决，谢谢。？
对于同一个测序文件中的两个高度相似的基因，它们的fragment计数可能会有所不同，这取决于多个因素： 1.基因的长度和结构： 基因的长度和结构可能会影响其在转录组测序中的fragment计数。较长的基因可能会产生更多的fragments，从而导致其fragment计数较高。此外，基因的结
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在转录组测序数据中筛选保护酶基因，可以通过以下步骤实现： 1.基因注释: 使用基因组或转录组注释数据库来获取关于已知保护酶的信息。这些数据库包括基因名称、功能描述等，可以帮助你确定哪些基因编码保护酶。 2.关键词搜索: 在转录组数据的基因注释中搜索与“保护酶”、“抗氧化”等相关的关键词或
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普通转录组测序的送样要求主要包括： 1.样品类型: 总RNA或富集的mRNA。 2.数量和质量: 足够的RNA量（通常要求至少为1-5 µg）。 高质量的RNA，通常使用RNA完整性数值（RIN）来评估，要求RIN通常在7.0以上。 3.纯度: OD260/280比率通常在1.8-2.
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对于新手来说，转录组分析可能看起来相当复杂，因为它包括多个步骤和对生物信息学工具的使用。但是，通过分步骤学习和使用用户友好的分析平台，新手也可以开始进行基本的转录组分析。在进行实际的研究之前，可以适当利用Coursera、edX和YouTube上的免费资源，了解生物信息学和转录组分析的基础。
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转录组测序（RNA-seq）所需的测序数据量取决于你的实验目标和研究类型，以下数据可供您参考： 1.基因表达定量: 对于基本的基因表达水平定量，通常每个样本需要至少30-50 million paired-end reads。 2.差异表达分析: 进行差异表达分析时，通常建议至少20-3
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转录组测序数据可以从以下几个方面解读： 1.基因表达定量: 分析每个基因的读段计数数据，这是基因表达水平的一个量化指标。 2.差异表达分析: 识别在不同条件或样本组之间表达水平显著不同的基因。 3.转录本组装和新转录本发现: 如果进行了全转录组测序，你可以通过组装读段来识别已知和新的转
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将转录组测序数据上传到GEO（Gene Expression Omnibus）数据库的步骤如下： 1.注册GEO账号： 在上传数据之前，你需要在GEO数据库上注册一个账号。可以通过访问GEO网站（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/）并点击“Register”
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三代全长转录组测序与RNA-seq是两种常用的转录组测序技术，它们在测序原理、应用范围和数据分析等方面存在一些区别。下面我将详细解答你的问题，并逐步解释这两种技术的区别。 1.测序原理： 三代全长转录组测序：三代测序技术主要包括PacBio SMRT（Single Molecule Re
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转录组测序（transcriptome sequencing）是一种利用高通量测序技术来研究转录组的方法，也就是说，它可以用来测定一个特定生物或细胞类型的所有RNA分子。而RNA测序（RNA-seq）是转录组测序的一种，是一种利用深度测序技术特异性地研究转录组中的mRNA（信使RNA）水平的
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• 跟大家请教一个问题，我的实验材料是花，做转录组、蛋白组测序取样该分离还是整花？
是否需要分离植物花的各个部分或使用整花进行转录组和蛋白组测序，这完全取决于研究的具体目标。 如果研究的目的是了解整个花朵的基因表达和蛋白质组成，那么可以使用整花进行取样。这样做简化了取样过程，并能提供一个全面的、整体的视角。 如果研究的目的是探索特定花朵部分（如花瓣、雄蕊、雌蕊等）中的基
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