什么是鸟枪法(Shotgun)蛋白质组学?

    在鸟枪法(Shotgun)蛋白质组学中,蛋白质被蛋白水解酶消化为肽段。质谱仪一次只能检测有限数量的肽,因此在进行 MS 分析之前,先将复杂的肽混合物在 nano-HPLC 上进行分离。从LC中洗脱得到的肽被喷射到MS中,并在电喷雾电离(ESI)过程中被高压电离为带电分子。 电离是必不可少的,因为质谱仪只能检测带电分子。从LC中洗脱的肽经一级质谱分析后可获取其质谱信息(MS光谱),并选择高丰度肽用于片段化和后续分析(MS/MS光谱)。每个单一的MS/MS谱图都在一个由生物体蛋白质组的理论质谱组成的数据库中进行搜索,数据库根据匹配的质量进行评分,使所有鉴定出的肽匹配到相对应的蛋白质中。


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