单细胞分析FAQ汇总

• • 单细胞 seurat 聚类后如何获取表达目的基因的细胞进展亚分群并对特定亚群感兴趣基因分组分析？

  在使用Seurat进行单细胞聚类后，获取表达目的基因的细胞亚群并对特定亚群进行感兴趣基因的分析可以按照以下步骤进行：1.获取表达目的基因的细胞亚群：首先，根据你感兴趣的基因列表，从Seurat对象的基因表达矩阵中筛选出这些基因的表达值。可以使用Seurat的函数如FetchData()或Su

• • 请问单细胞测序分析数据R代码无法聚类细胞怎么处理？

  如果单细胞测序分析数据在R代码中无法聚类细胞，可能是由于数据质量问题、参数设置不当或其他原因导致的。解决这个问题可以尝试以下方法：1.数据质控和预处理：首先，对单细胞测序数据进行质控和预处理。检查数据质量，排除低质量的细胞和基因表达值，进行数据归一化和转换等预处理步骤，以确保数据的可靠性和一

• • 如果对同一组织进行单细胞测序，那么得到的聚类都是一样的吗，还是说可以根据人为设定而产生不同的聚类结果

    单细胞测序允许研究者在单个细胞水平上分析基因表达，从而揭示细胞群体中的异质性。然而，从单个细胞数据得到的聚类结果并非始终一致，这主要由以下几个因素决定：   1.实验操作的差异：尽管可能针对的是同一组织，但实验操作的差异（比如样本处理、测序深度等）可能会影响到得到的数据质量，从而影响后续

• • 什么是质谱流式（Mass cytometry）？

  质谱流式技术结合了传统流式细胞术常见的单细胞、高速分析的优势，能够以原子质谱常见的最小信号重叠分辨100多种金属探针，从而为研究人员提供无与伦比的表型和功能分析能力以分析正常和患病状态的细胞。相关服务:单细胞质谱流式技术分析

• • Helios和Hyperion质谱流式成像系统有何不同？

  Helios™ 是最新一代的质谱流式细胞仪系统。它旨在分析​​悬浮细胞中的金属标记抗体。 Hyperion™ 成像系统包括一个单独的模块，可连接到Helios以分析组织中的金属标记抗体。它使用激光消融技术，可以将金属标签与其在组织切片上的空间位置相关联。相关服务:单细胞质谱流式技术分析

• • 什么是质谱流式成像（Imaging Mass Cytometry,IMC）?

  质谱流成像是一种基于质谱仪的组织成像平台，它使用高分辨率激光烧蚀，然后将烧蚀的材料转移到质谱仪，对金属离子进行飞行时间质谱检测，以生成高维图像数据，可以对目标蛋白表达、细胞类型、它们的功能状态和空间相互作用进行全面分析。相关服务:单细胞质谱流式技术分析

• • 质谱流式成像与多重免疫荧光有何不同？

  免疫荧光(Immunofluorescence,IF)基于被一种波长激发并以更长波长发射的荧光团来成像。使用 IF的多重研究受到大多数有机荧光染料的宽发射光谱的挑战，导致各通道之间有重叠或串扰，这限制了可以同时测量的目标蛋白的数量。 质谱流式成像（Imaging Mass Cytometry

• • 质谱流式成像IMC数据的图像分辨率是多少？

  凭借1µm的激光束尺寸，IMC能够以亚细胞空间分辨率对组织进行可视化和分析（典型的免疫细胞直径为5-7微米）。相关服务:单细胞质谱流式技术分析

• • 质谱流式成像IMC适用于分析哪些类型的样本？

  通常来自任何生物体的任何组织都可进行IMC分析，这些组织可以轻松切片到 4-5 µm，并且具有可用于细胞标记的已知抗体。IMC与OCT嵌入式冷冻切片和FFPE切片兼容。对于FFPE类临床病理学样本， 为了获得最佳的IMC检测性能，应在冷缺血条件下适当固定FFPE组织，冷缺血时间少于1小时。使

• • 可以使用IMC研究骨髓样本吗？

  除了用B5固定的骨髓样本外都可以进行IMC研究。由于不同的脱钙方法会导致某些抗体的功能不同，因此在用于实验样品之前，应在适当的对照组织上验证所有抗体。相关服务:单细胞质谱流式技术分析