我想询问化学计量法,主成分分析、偏最小二乘的原理以及怎么绘图?

    在化学计量学中,主成分分析(PCA)和偏最小二乘回归(PLS)都是关键的数据分析工具。以下是这两种技术的原理和绘图方法:

     

    一、主成分分析(PCA)

    1. 原理:

     PCA 通过正交变换将可能相关的变量转换为一组线性不相关的变量,称为主成分。它的目标是找出数据中方差最大的方向,并在这些方向上投影数据,以减少数据集的维数。

     

    2. 绘图:

    通常使用散点图来表示主成分,以便可视化数据的内在结构。例如,可以绘制第一主成分和第二主成分的散点图,以查看样本之间的聚类情况。这些图形通常可以用统计软件包如R、MATLAB或Python中的相关库(例如matplotlib, seaborn, scikit-learn)来生成,此处以Python软件为例,使用的库是matplotlib。

    1797558102071021568-PCA.png

     

    二、偏最小二乘回归(PLS)

    1. 原理:

     PLS 可同时分析解释变量和响应变量的结构,通过寻找这两组数据之间最大协方差的方向,来提取对预测响应变量最有用的信息。

     

    2. 绘图:

    PLS 分析常用于绘制预测结果与实际结果的对比图,以及载荷图(loadings plot)和得分图(scores plot)来展示模型中变量的相互关系。以Python软件为例,使用的库是scikit-learn。

    1797558373316661248-PLS.png

     

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    相关服务:

    主成分分析(PCA)

    PLS-DA/OPLS-DA二维图

    代谢组学生物信息学分析

    代谢组学数据质量评估

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