请问pull down下拉的蛋白都能够通过质谱鉴定出来吗?
不是所有pull down下拉的蛋白都能通过质谱鉴定。鉴定成功与否取决于多个因素:
1.蛋白质的丰度:
高丰度蛋白容易被鉴定,而低丰度蛋白可能难以检测。
2.样品准备:
样品处理过程中可能会丢失蛋白,尤其是对于易于降解或粘附于管壁的蛋白。
3.质谱灵敏度:
质谱仪的灵敏度决定了能检测到的蛋白质的最低丰度限。
如果进行pull down实验捕获了一种低丰度蛋白,并且在样品处理过程中部分丢失,那么即使使用高灵敏度的质谱设备也可能难以检测到这种蛋白,尤其是在复杂样品(如细胞裂解物)中。
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