KEGG通路分析中P值校正后的FDR是表示富集程度高还是p值小,我只知道圆点大表示蛋白质数量多,不太懂FDR的意思
FDR是多重假设检验中的一个概念,用于控制错误发现的比率。在进行大量的假设测试时(例如,检查数千个基因是否与某种疾病相关),我们可能会得到许多统计上显著的结果,但其中一些可能只是偶然的。为了控制这种假阳性,我们使用FDR。它的值在0到1之间,FDR越低,表示通路富集的信度越高。
所以,FDR表示的是信度,而不是富集程度或P值的大小。一般来说,FDR越小,表示该通路的富集结果越可靠。在KEGG通路分析中,你应该关注那些FDR值较小的通路,因为它们更可能是真正与你的研究相关的通路。
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