GST pull-down蛋白相互作用分析:亲,这个有具体步骤吗?
GST pull-down是一种常见的蛋白质相互作用研究方法。其原理是GST标签能与还原型谷胱甘肽(GSH)紧密结合,在GST pull-down实验中,就是利用这种特性,将一个蛋白质("bait"蛋白)与GST标签融合,然后通过GST标签和谷胱甘肽的结合将目标蛋白固定在谷胱甘肽覆盖的珠子(比如谷胱甘肽琼脂糖珠子)上,再加入其他蛋白("prey"蛋白),如果这些蛋白和固定的蛋白有相互作用,那么它们就会被一同拉下(pull down),然后通过洗涤去掉不结合的蛋白,留下结合的蛋白,进一步进行分析。
以下是进行GST pull-down实验的大致步骤,希望可以帮到您:
一、表达和纯化GST融合蛋白:
你需要将目标蛋白(bait蛋白)的基因克隆到含有GST标签的质粒中,然后将其转化到大肠杆菌或酵母等表达系统中。经过一定时间的表达后,收集细胞,然后破碎细胞以释放蛋白。蛋白的纯化是通过利用GST蛋白与谷胱甘肽的亲和力,经过洗涤和洗脱步骤后获得。
二、制备细胞提取物:
将你希望进行相互作用检测的细胞或组织(含有可能与bait蛋白相互作用的prey蛋白)破碎,制备成细胞提取物。
三、GST pull-down:
1.将纯化的GST融合蛋白和细胞提取物混合在一起,孵育一段时间(通常是在4°C下孵育几小时或过夜),使得有可能的蛋白-蛋白相互作用发生。
2.添加谷胱甘肽覆盖的珠子(如谷胱甘肽琼脂糖珠子)到孵育混合物中,经过一段时间孵育(通常1-2小时),然后通过离心等方法分离珠子。由于GST融合蛋白会与谷胱甘肽珠子结合,因此如果有任何蛋白与GST融合蛋白相互作用,它们也会被一同拉下。
3.使用相应的洗涤缓冲液清洗珠子,以去除非特异性结合的蛋白。这个步骤可能需要重复几次以确保清洗干净。
4.将与GST融合蛋白相互作用的蛋白从珠子上洗脱出来。这通常通过使用含有高浓度谷胱甘肽的缓冲液来实现,因为谷胱甘肽可以与GST蛋白结合,从而将GST融合蛋白(以及与之结合的蛋白)从珠子上洗脱下来。
四、后续鉴定:
洗脱下来的蛋白可以进行进一步的分析,如SDS-PAGE电泳,然后通过银染或Western blot来检测特定的蛋白。如果你已经知道你正在寻找哪个蛋白,你可以使用特定的抗体进行Western blot分析。如果你不知道可能与bait蛋白相互作用的蛋白,你可以将银染的凝胶切下来,进行蛋白质质谱分析,来鉴定蛋白的身份。
这只是GST pull-down实验的大致步骤,具体的步骤可能会因为不同的实验设计和目标而略有不同。
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