请问细胞体内交联和先裂解再交联有什么区别呢?
交联(cross-linking)法通过化学反应将两个或两个以上的分子链接在一起,这种技术常常被用于固定细胞内的分子在某一时刻的相对位置,帮助研究者更好地理解细胞内的生物过程,也是蛋白质相互作用研究中的重要技术。交联试剂可以在蛋白质相互作用时将它们共价交联在一起,捕获蛋白质-蛋白质复合物,冻结短暂微弱的相互作用,从而实现对短暂相互作用蛋白的分离和表征。
一般来说,交联过程在体内或体外都可以进行,使用体内还是体外交联取决于项目的需求。两者区别在于,蛋白质在体内交联过程中以天然状态交联,而对于体外交联,蛋白质可能会发生变性。
1.细胞体内交联:
体内交联反应的过程中,蛋白质交联反应发生在细胞内部,因此可以消除假阳性的相互作用及蛋白质复合物稳定性丧失的风险。位于细胞膜内的蛋白质通常使用疏水性和脂溶性交联剂进行交联反应,而位于细胞膜上的蛋白质(如血浆锚定的受体)通常使用亲水性和水溶性交联剂进行交联反应。尽管蛋白质保持天然状态,但由于细胞中蛋白质的复杂性,体内交联的优化过程也可能很复杂,仍然存在发生非特异性交联反应的可能性,可以通过使用间隔臂较短的交联剂来消除非特异性交联的问题。
2.先裂解再交联:
在体外交联过程中,细胞被均质化,裂解。因此,该方法更适合分析较稳定的蛋白质-蛋白质相互作用。由于在特定的裂解缓冲液中对细胞进行裂解,想要对反应条件进行控制变得比较容易,如温度、pH、离子强度等反应条件都可以进行调整。因为不在受到体内环境的限制,也有更多类型的交联剂可供选择,也可以更好的控制非特异性交联。
总的来说,选择哪种方法取决于你的研究目标。如果你希望捕获活细胞中的蛋白质互作,那么建议你选择体内交联。而如果你更关心在裂解液中的蛋白质互作,那么你可以选择先裂解再交联。
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