预测N糖基化位点

    N糖基化位点指发生N糖基化修饰的糖蛋白上肽链基酸残基与糖链共价结合的位点,N糖基化修饰具有位点特异性,其发生在-Asn-X-Ser/Thr或-Asn-X-Cys-(稀有)序列上,其中X为除脯氨酸以外的其他任何氨基酸。

     

    通过N糖基化位点特异性,可根据糖蛋白/糖肽氨基酸序列信息预测N糖基化位点信息。N糖基化位点预测策略:经过N糖基化修饰的蛋白经过胰蛋白酶水解得到糖肽,糖肽经过分离、纯化以及富集后通过质谱检测,得到糖肽氨基酸序列信息借助生物信息学技术分析,即可预测N糖基化位点。

     

    在对糖肽的氨基酸序列进行生物信息学分析时,需要考虑经胰蛋白酶解后的短肽在肽段中的起始位点与终止位点,然后根据N糖基化修饰位点特异性对肽段氨基酸序列进行分析,得到肽段序列潜在的糖基化位点的数目、潜在的N糖基化位点及其位点在氨基酸序列中的确切位置等信息,综合上述分析即可实现N糖基化位点的预测与分析。

     

    百泰派克生物科技提供N糖修饰及修饰位点分析服务,可对修饰位点、特定的聚糖种类进行鉴定,对N糖修饰类型及修饰位置进行分析,可以解析N糖的结构及位置,且可实现聚糖修饰定量分析。您只需将实验目的告知并将样品寄出,我们将负责项目后续所有事宜,包括蛋白提取、蛋白酶切、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析。

     

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