蛋白质组学常用的质谱
一、液相色谱质谱联用技术(LC-MS)
液相色谱质谱联用技术(Liquid Chromatography-Mass Spectrometry,LC-MS)是一种常用的蛋白质质谱技术。这种技术通过液相色谱将蛋白质分离,然后通过质谱测定每个蛋白质的质量和化学修饰。LC-MS技术有很高的灵敏度和准确性,可以测定复杂蛋白质样本的组成。
二、串联质谱技术(MS/MS)
串联质谱技术(Tandem Mass Spectrometry,MS/MS)是一种高灵敏度的质谱技术。它通过两次质谱分析,可以获得蛋白质的序列信息和修饰信息。MS/MS技术被广泛用于蛋白质鉴定和定量。
三、基于标记的定量技术(如iTRAQ和TMT)
基于标记的定量技术是一种定量蛋白质的方法。这种方法通过标记蛋白质或肽段,然后通过质谱比较不同样本的标记强度,从而实现蛋白质的定量。iTRAQ(Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tag)是两种常用的标记定量技术。
四、基于标记的定量技术(如SILAC和DM)
基于标记的定量技术是一种定量蛋白质的方法。这种方法通过标记蛋白质或肽段,然后通过质谱比较不同样本的标记强度,从而实现蛋白质的定量。SILAC(Stable Isotope Labeling by Amino acids in Cell culture)和DM (Dimethyl Labeling) 是两种常用的标记定量技术。

图1. SILAC技术实验流程
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