itraq技术
iTRAQ(Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation)是一种常用于蛋白质组学研究的质谱标记技术,特别适用于定量分析样本中蛋白质的相对和绝对丰度。这种技术通过使用同质量的标记试剂(iTRAQ试剂)标记样本中的肽段,然后通过质谱分析来比较不同样本间蛋白质的表达差异。
一、iTRAQ技术的基本原理
1.样本准备:
首先提取样本中的蛋白质,并通过酶(通常是胰蛋白酶)进行消化,产生肽段。
2.标记:
将不同的iTRAQ试剂标记到不同样本的肽段上。每个iTRAQ试剂由一个平衡区域(保持整体标记试剂的质量不变)和一个报告区域(在质谱分析中释放,用于检测和定量)组成。不同的试剂标记对应不同的报告离子峰,但在质谱分析前保持同等质量。
3.混合:
将所有标记过的样本混合在一起,这允许在单次质谱分析中同时处理和比较多个样本。
4.质谱分析:
通过液相色谱-质谱(LC-MS/MS)技术分离混合样本中的肽段并进行质谱分析。在MS/MS分析中,iTRAQ标记的肽段被进一步碎片化,释放出特定质量的报告离子,这些报告离子的强度反映了原始样本中对应肽段的丰度。
5.数据分析:
利用专门的软件分析质谱数据,根据报告离子的强度计算蛋白质在不同样本中的相对丰度。
二、iTRAQ技术的优点
1.多样本分析:
可以在一个实验中同时分析多达8个(或更多,取决于iTRAQ试剂版本)不同的样本,提高了实验的通量和效率。
2.高灵敏度和精确性:
iTRAQ技术能够检测低丰度蛋白质,提供高精度的定量信息。
3.宽广的应用范围:
适用于各种生物样本(如细胞、组织、血液等)的蛋白质表达分析,广泛应用于疾病机理研究、药物靶标发现和生物标志物的鉴定。
三、iTRAQ技术的局限性
1.成本:
相对于无标记定量方法,iTRAQ标记的成本较高。
2.复杂性:
数据分析需要专业的软件和相对复杂的数据处理流程。
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