Edman 降解法:蛋白质和小肽的N-末端氨基酸序列测定技术

    Edman 降解法是一种用于确定小肽和蛋白质的N-末端氨基酸序列的方法。这种方法是基于周期性地移除肽链N-末端的氨基酸并检测该氨基酸的身份。这个过程可以重复进行,从而连续地确定多个氨基酸的顺序。


    Edman降解的大致步骤如下:


    1.肽键选择性标记

    首先,样品与Edman试剂(酚酞异硫氰酸)反应,这会特异性地与肽的N-末端氨基酸形成一个环状酞酰化衍生物。


    2.酞酰化衍生物的裂解

    经过酞酰化后,酞酰化氨基酸可以通过温和的酸性条件(如三氟醋酸)从肽链上释放出来,而不破坏肽链上的其它氨基酸。


    3.氨基酸检测

    释放的酞酰化氨基酸可以通过色谱法进行分离和检测,从而确定其身份。


    4.重复过程

    剩余的肽再次与Edman试剂反应,释放下一个N-末端的氨基酸,如此反复进行。


    Edman测序反应过程2

    图1


    虽然这个方法在确定小肽的序列上很有用,但它有一些局限性。其中最大的局限性是它在降解过程中会出现效率损失,这通常使得连续降解超过15-20个氨基酸变得困难。对于较大的蛋白质,通常需要将其分解为较小的片段,然后对这些片段进行Edman降解。


    近年来,由于质谱技术的进步,质谱成为了蛋白质序列和鉴定的主要工具,但在某些情境下,Edman降解仍然是一个有用的补充方法。


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