无标记定量蛋白组学

无标记定量技术（Label-free）是研究定量蛋白质组学的技术之一，相较于传统的标记定量技术，无标记定量蛋白技术具有显著的优势。传统的标记定量方法通常涉及复杂的实验步骤，耗时耗力，并且标记试剂成本高昂。然而，无标记定量技术无需特殊的实验操作要求，省去了繁琐的标记步骤，使得实验流程更加简洁高效。此外，该技术成本相对较低，样品制备也相对简单。目前使用最广泛的非标记定量方法主要有2种，一种是基于质谱峰的峰面积或峰强度来进行定量，另外一种是基于蛋白的肽段鉴定数来进行定量。

1、基于质谱峰的峰面积或峰强度来进行定量

其原理基于肽段质谱信号与其含量之间的相关性，通过比较不同样品中相同肽段的峰面积或峰强度，可计算出该肽段在不同样品中的相对含量。这种方法也被称为离子强度法或信号强度法。

2、基于蛋白的肽段鉴定数来进行定量

丰度较高的蛋白酶解后，其产生的肽段在质谱检测中的可见性增强，被检测到的几率也大大提高。基于这一原理，可观察到蛋白的丰度与其酶解后产生的肽段鉴定数之间呈现出显著的正相关关系。因此，可以通过比较不同样品中蛋白的肽段鉴定数实现对蛋白的相对定量。

图1 Label-free技术的实验过程

应用场景：Label-free技术特别适用于分析复杂度较低的样品，如Co-IP、pull-down、亚细胞组分、DARTS样品等。在这些情况下，该技术能够提供准确且高效的蛋白质定量结果。此外，还常用于大样本量的定量比较，以及对无法用标记定量实现的实验设计。

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