质谱法N端序列检测

蛋白N端序列检测方法主要包括质谱法和Edman降解法，质谱法N端序列检测是基于质谱检测的方法对蛋白样品的一级结构氨基酸序列进行测定，其原理是通过质谱高能碰撞破碎肽段间的共价键来实现氨基酸残基序列的分析。

质谱法N端序列检测通过LC-MS/MS采集的氨基酸质谱数据与理论氨基酸序列进行匹配，进而确认蛋白N端序列。基于质谱法测序的蛋白肽段N端氨基酸序列信息有利于研究蛋白的高级结构，并进一步揭示蛋白的生物学功能。相对于Edman降解法测序，质谱法N端序列检测不受N端封闭、环化或化学修饰的干扰，其检测灵敏度更高，可以更快的裂解肽段、识别末端封闭或修饰的蛋白样品。

百泰派克生物科技采用Thermo公司推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪，开发出以质谱为基础的基于质谱的序列分析技术，实现对蛋白样品的序列分析。Obitrap Fusion Lumos质谱仪是现在分辨率和灵敏度最高的质谱仪，保证了低丰度肽段碎裂片段鉴定的灵敏度；同时在肽段碎裂过程中采取HCD与ETD结合的模式，保证肽段碎裂片段的完整性。可以实现蛋白样品的N端，C端序列分析，蛋白全长序列分析。对未知理论序列的样品，可通过从头测序法进行序列分析。