代谢组学FAQ汇总

• • 粪便在-80°C冷冻3年，能检测肠菌吗? 放置太久会不会影响结果? 血清也冻存了3年，对非靶向代谢物检测有无影响?

  1、粪便样本冻存用于肠道菌群分析： 冻存粪便样本在 -80°C 是微生物研究中的标准做法，可以很好地保留样本中的细菌DNA，使其适合于后续的肠道菌群分析。尽管样本被冻存了3年，但在这种低温下，DNA的降解速度非常慢，仍然可以进行肠道菌群的检测和分析。然而，长时间的冻存可能会影响样本中

• • 测硫醇的过程中为什么要加入盐酸胍？

  在测定硫醇的过程中加入盐酸胍（hydroxylamine hydrochloride）主要是为了消除硝酸盐对分析结果的干扰。硝酸盐在某些情况下可以氧化硫醇，导致分析结果偏低。盐酸胍可以与硝酸盐反应，将其还原为氮气和水，从而防止硫醇被氧化，确保测定结果的准确性和可靠性。 百泰派克生物科技&m

• • 怎么通过感兴趣的通路做WGCNA图并找到其中的关键基因？

  一、数据准备: 首先，需要有一组高质量的基因表达数据，通常是来自RNA-seq或微阵列实验的数据。 二、数据预处理: 对数据进行标准化处理，去除批次效应（如果有的话），并筛选掉表达量极低的基因。 三、选择感兴趣的通路: 根据你的研究目标，从已知的生物信息数据库（如KEGG, Reacto

• • PLS-DA/OPLS-DA二维图的q2是负数，可以通过哪些参数进行调试呢？

  PLS-DA（Partial Least Squares Discriminant Analysis）和OPLS-DA（Orthogonal Partial Least Squares Discriminant Analysis）中的 Q2 值为负数通常表示模型的预测能力不佳。Q2值是一种交

• • 多糖纯度应该怎么计算？

  多糖的纯度计算通常依赖于特定的分析技术，如高效液相色谱（HPLC）或凝胶渗透色谱（GPC），不同的分析方法可能需要不同的计算方式，这里介绍一种基于色谱技术的纯度计算方法：   1.样品制备与分析： 首先，将多糖样品通过适当的色谱系统进行分析。   2.峰面积计算： 在色

• • 怎么通过多糖部分酸水解知道末端，侧链，支链，主链？

  单纯通过酸水解方法确定多糖的末端、侧链、支链和主链结构是比较有限的。酸水解主要用于将多糖分解成较小的片段，但仅凭这一步骤很难获得关于多糖精确结构的详细信息，通常需要结合使用更高级的分析技术，例如，质谱可以提供关于分子量和组成的信息，而NMR可以提供关于糖残基排列和连接方式的详细信息。 百泰

• • 请问多糖部分酸水解的袋内袋外里面都是什么？

  多糖部分酸水解的过程是将多糖（如淀粉、纤维素等）在酸性条件下部分分解成较小的分子。在这种情况下，多糖样本被放在一个透析袋或类似的容器中。然后，这个袋子被浸泡在含有酸的溶液中。酸通过袋子的膜部分分解多糖，产生较小的糖分子。这些小分子可能通过膜移动到袋外的溶液中。 在袋内部，多糖部分酸水解可能

• • 脂质代谢组学研究中，组织提取脂质的办法？

  在脂质代谢组学研究中，组织提取脂质的常用方法如下： 1.样品制备： 收集组织样本：确保样本新鲜，并迅速将其冷冻以防脂质氧化。 称重：精确记录样本的重量，以便后续计算脂质浓度。 2.均质化： 使用均质器（如珠磨机、超声破碎机等）在冷却条件下将组织样本均质化，以释放细胞内的脂质。 3.

• • 请问PLAS-DA得分图横纵坐标的百分数和模型的准确率有没有关系？做出来横纵坐标的百分数加起来才百分之二十几，会不会太低了？

  PLAS-DA（偏最小二乘判别分析）得分图中的横纵坐标百分数代表了在对应轴上解释的变异百分比。这些百分比与模型的整体准确率并不直接相关。在PLS-DA中，每个轴（成分）捕捉数据中的一部分变异，而这些变异可能与类别判别相关或不相关。 如果横纵坐标的百分数加起来只有20%左右，这意味着这两个成

• • 如何提取皮肤脂质Cer FFA Chor

  以下是提取皮肤脂质的大致流程： 1.样品采集： 首先，从皮肤表面采集样品。可以通过刮取、使用带有溶剂的拭子或其他方法完成。如样品为冻存的皮肤组织，需在低温下切割成小块以便于后续处理。 2.均质化： 使用均质器（如珠磨机或超声破碎机）在冷冻条件下对皮肤样品进行均质化，确保脂质充分释放。