Mascot蛋白鉴定
Mascot是一款经典的蛋白鉴定数据库软件,也是常用的肽质量指纹图谱(PMF)检索工具,在质谱鉴定蛋白质中发挥重要作用。蛋白肽段经质谱仪检测后获得质谱数据需要与理论数据库中的数据进行比较和评价,才能将实验数据转换成具有生物学意义的结果。
利用Mascot软件进行检索时,需要根据样品及仪器的实际使用情况设置相应的检索参数以限制检索范围。检索参数主要包括检索的数据库Database、所使用的水解酶、未水解的酶切位点数、固定修饰、可变修饰、蛋白质分子质量上限以及肽分子质量误差范围等。数据库一般采用NCBI的非冗余库(NCBInr);肽分子质量误差范围值设置越小,检出的结果就越少,目标蛋白质的检索得分值与其他蛋白的得分值差距就越大。
百泰派克生物科技采用高分辨率质谱平台提供蛋白质鉴定服务技术包裹,包括蛋白质质谱鉴定、膜蛋白鉴定、肽质量指纹图谱鉴定以及蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白质鉴定等,欢迎免费咨询。
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